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單細(xì)胞marker整理
##20220423 ESCC_marker plasma： IGHG3、IGHG1徽惋、MZB1 JCHAIN B： CD79A回怜、MS4A1距辆、IGHM、CD19蔽氨、CD79A藐唠、C...
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Monocle3：擬時(shí)序分析寫在前面：今天突然想寫這個(gè)教程宇立，花了一下午看資料，其實(shí)我前面是有一些基礎(chǔ)的自赔，但是看的還是會(huì)很亂泄伪，所以想把這個(gè)包的脈絡(luò)寫一下，希望能夠可以跟大家討論一下并且自己以后使用這個(gè)包的...
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【單細(xì)胞】單細(xì)胞數(shù)據(jù)的批次效應(yīng)在數(shù)據(jù)分析的時(shí)候匿级，我們的目標(biāo)是一般都是找到樣本之間真實(shí)的生物學(xué)差異蟋滴。但是這種真實(shí)的生物學(xué)因素往往會(huì)受到各種因素影響，舉幾個(gè)場(chǎng)景： 不同樣本 同一樣本的生物學(xué)重復(fù) 同一樣本的技...
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sed '/HPV/d' test2.gtf > test.gtf
從序列到表達(dá)矩陣
平臺(tái)：Linux 服務(wù)器痘绎、Rstudio數(shù)據(jù)：NCBI數(shù)據(jù)庫（SRR2932830） 1.下載序列 參考 菜鳥自學(xué)之——SRA Toolkit 的下載和使用https://b...
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轉(zhuǎn)錄組入門（5）：序列比對(duì)作業(yè)要求 比對(duì)軟件很多津函，首先大家去收集一下，因?yàn)槲覀兪菐Т蠹胰腴T孤页，請(qǐng)統(tǒng)一用hisat2尔苦，并且搞懂它的用法。直接去hisat2的主頁下載index文件即可行施，然后把fastq格式...
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從序列到表達(dá)矩陣平臺(tái)：Linux 服務(wù)器允坚、Rstudio數(shù)據(jù)：NCBI數(shù)據(jù)庫（SRR2932830） 1.下載序列 參考 菜鳥自學(xué)之——SRA Toolkit 的下載和使用https://b...
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