適用背景 昨天寫的文章[http://www.reibang.com/p/8a81071571d9]介紹了Anndata對象轉(zhuǎn)成Seurat對象的流程孵户，但是比較稀碎，所以這...
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【函數(shù)整理版】從Scanpy的Anndata對象提取信息并轉(zhuǎn)成Seurat對象2022-06-15
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scanpy官方教程2022||03-scanpy包核心繪圖功能學(xué)習(xí)資料來源：scanpy主頁：https://scanpy.readthedocs.io/en/stable/[https://scanpy.readthedocs.io/...
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單細胞Scanpy常用腳本2023-08-28
前言 Scanpy是基于Python語言的類似Seurat的單細胞轉(zhuǎn)錄組分析工具，本文匯集了Scanpy的常規(guī)操作晴玖。 加載模塊和設(shè)置 讀入矩陣 合并多個對象 添加注釋 輸出矩...
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四步完成單細胞數(shù)據(jù)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)流程分析-SCENIC/pySCENIC-2022-09-06適用背景 單細胞轉(zhuǎn)錄組調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析是單細胞轉(zhuǎn)錄組分析內(nèi)容的高級分析之一，本文將介紹SCENIC/pySCENIC的流程，具體原理和內(nèi)容不展開，主要展示代碼復(fù)現(xiàn)流程飘庄。R的SCE...
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利用matplotlib保存圖片ref[https://blog.csdn.net/baidu_41798699/article/details/120267005] 一定要保存為嵌入字體信息的PDF购撼，不然...
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RNA velocity處理流程關(guān)于RNA velocity RNA velocity介紹[http://www.reibang.com/p/70c19748ac1a] RNA速率跪削，即基因表達狀態(tài)的時間導(dǎo)...
