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【函數(shù)整理版】從Scanpy的Anndata對(duì)象提取信息并轉(zhuǎn)成Seurat對(duì)象2022-06-15
適用背景 昨天寫的文章[http://www.reibang.com/p/8a81071571d9]介紹了Anndata對(duì)象轉(zhuǎn)成Seurat對(duì)象的流程佛纫，但是比較稀碎，所以這...
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scanpy官方教程2022||03-scanpy包核心繪圖功能學(xué)習(xí)資料來源：scanpy主頁(yè)：https://scanpy.readthedocs.io/en/stable/[https://scanpy.readthedocs.io/...
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單細(xì)胞Scanpy常用腳本2023-08-28
前言 Scanpy是基于Python語(yǔ)言的類似Seurat的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析工具攒盈，本文匯集了Scanpy的常規(guī)操作。 加載模塊和設(shè)置 讀入矩陣 合并多個(gè)對(duì)象 添加注釋 輸出矩...
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四步完成單細(xì)胞數(shù)據(jù)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)流程分析-SCENIC/pySCENIC-2022-09-06適用背景 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析內(nèi)容的高級(jí)分析之一，本文將介紹SCENIC/pySCENIC的流程尚蝌，具體原理和內(nèi)容不展開迎变，主要展示代碼復(fù)現(xiàn)流程。R的SCE...
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利用matplotlib保存圖片ref[https://blog.csdn.net/baidu_41798699/article/details/120267005] 一定要保存為嵌入字體信息的PDF姿鸿，不然...
