軟件 1.JCVI2.NGenomeSyn3.synvisio在線工具：鏈接 https://synvisio.github.io/[https://synvisio.git...
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「基因組」基因共線性可視化（待更新） -
genblastg和genewise鑒定缺失基因
基于組裝好的基因組，例如某一個基因在該基因組中無注釋，需檢查是否為注釋錯誤，還是該基因本身缺失。 軟件：genblastg和genewise genblastg下載地址：ht...
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接上挤悉，pcoc檢測氨基酸性質的趨同
pcoc檢測 step1. 處理樹文件；將第2步生成的02_Trees文件夾拷貝到當前目錄，并修改為.txt結尾 step2：處理序列文件 step3: 準備需要檢測物種的文...
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僅作個人筆記 - 基于fithic的輸出結果統(tǒng)計染色體體間顯著互作的密度0.僅作個人筆記使用意思就是只考慮我能不能看懂 fithic的安裝歉闰、使用這里略去假定已經(jīng)運行完了fithic 輸入文件長這樣: 輸出文件: 最后畫一個核型圖 核型圖的繪制參考...
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WGDI - 推斷祖先核型0.僅作個人筆記使用意思就是只考慮我能不能看懂具體每個參數(shù)的含義參照官方文檔, 這里全部用默認參數(shù)https://wgdi.readthedocs.io/en/latest/...
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ChromoSSE: 染色體數(shù)目進化/Chromosome Number Evolutionhttps://github.com/wf8/ChromoSSE[https://github.com/wf8/ChromoSSE] 1.輸入文件的準備.兩個文件, 一個是進...
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2023-09-21 PSMC可以評估有效群體大小的原因
介紹這個軟件的概念前卓起，我需要先解釋一個概念最近共同祖先時間（the time since the most recent common ancestor和敬，TMRCA）。當我們...
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隨筆 | 十年之后戏阅，我們?nèi)匀粵]能坐在一起喝上一口啤酒時間過得很快昼弟，或許可以說，從7月底到現(xiàn)在奕筐，我仍然沒有忙完手頭的事情舱痘。上午收到消息時变骡，我仍然在趕著項目，有時候芭逝，不知道是對是錯塌碌。多算一年半年，與基友「醬油」認識可能也是10年旬盯。...
