作者，Evil Genius 關于空間轉(zhuǎn)錄組的整合分析已經(jīng)是非常常見了颖对，昨天分享的是python版本，隨著數(shù)據(jù)量不斷地增大取具，R版本的計算效率明顯下降，但是作為一種更加具有接受...
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課前準備----空間轉(zhuǎn)錄組R版本的harmony整合（封裝版）
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Metaneighbor - 探究不同研究中的細胞亞類的相關性MetaNeighbor/Documentation.md at master · gillislab/MetaNeighbor · GitHub[https://githu...
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Fit-hic 2 通過hic數(shù)據(jù)檢測顯著性互作安裝官網(wǎng)中提到三種安裝方法扁耐，可通過conda, pip暇检，git clone 安裝該軟件.我們這里利用conda,非常簡單快速.1.1 conda創(chuàng)建環(huán)境 1.2 conda ...
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cell2location學習筆記Cell2location 是一個原則性的貝葉斯模型，它可以解析空間轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)中的細胞類型婉称，并創(chuàng)建不同組織的全面細胞圖块仆。Cell2location 解釋了變異的技術來源构蹬，并借用...
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10X空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之細胞百分比餅圖的繪制作者，追風少年i 最近一直有人問我空間轉(zhuǎn)錄組的餅圖該如何繪制悔据，如下圖 之前呢庄敛，說過一些，大家可以借鑒 10X空間轉(zhuǎn)錄組繪圖之細胞類型百分比餅圖和空間密度分布圖[https:/...
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10X單細胞空間聯(lián)合分析方法匯總及算法總結(jié)hello科汗，又是周一藻烤，新的開始，今天是二月二十八日头滔，對于臺灣同胞來說是一個沉重的日子隐绵，時間很快，快到我們毫無感覺就到了30歲拙毫，而立之年，這一篇我們進行一下匯總棺禾，對單細胞空間聯(lián)...
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10X單細胞數(shù)據(jù)整合分析Seurat之rpca（large data缀蹄，細胞量超過20萬）不知道大家在研究單細胞數(shù)據(jù)整合函數(shù)FindIntegrationAnchors[https://satijalab.org/seurat/reference/FindInte...
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MetaPhlAn2宏基因組物種注釋導讀 上一篇介紹了MetaPhlAn：宏基因組微生物分類分析教程[http://www.reibang.com/p/015cbdb80ce1]，這次來學習MetaPhlAn...
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不斷學習膘婶，不斷忘記缺前，不斷回顧，不斷進步悬襟，這便是凡人的學習方式,或謂曰：Attention is all you need,but learning is all your attention.