發(fā)簡(jiǎn)信
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0701coming最近在看網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)相關(guān)的內(nèi)容推薦一個(gè)好用的網(wǎng)站，根據(jù)蛋白質(zhì)uniprot轉(zhuǎn)換為基因名（無(wú)需代碼）https://www.uniprot.org/uploadlists/網(wǎng)站名...
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全基因組甲基化分析簡(jiǎn)述DNA甲基化是一種非惩饫铮基礎(chǔ)且重要的表觀修飾怎爵，在調(diào)控基因表達(dá)、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合和抑制轉(zhuǎn)座子元件中起到關(guān)鍵的作用盅蝗。 目前鳖链，DNA甲基化檢測(cè)的技術(shù)已經(jīng)比較成熟，例如高通量的WGBS墩莫、R...
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GSEA相關(guān)筆記整理網(wǎng)頁(yè)上關(guān)于GSEA富集分析的教程很多芙委，對(duì)自己這個(gè)生信小白來(lái)說(shuō)比較簡(jiǎn)單通俗易懂的當(dāng)數(shù)生信寶典和生信技能樹(shù)的教程了。感謝大佬們的付出狂秦。下面是自己整理的個(gè)人學(xué)習(xí)筆記灌侣，可能有理解不對(duì)...
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【單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組1】GSVA分析小鼠的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)目的：用GSVA分析單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù) 基因集變異分析（GSVA）是一種非參數(shù)，無(wú)監(jiān)督的方法故痊，用于通過(guò)表達(dá)數(shù)據(jù)集的樣本估算基因集富集的差異顶瞳，即基于通路上的差異分析 一、GSVA...
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問(wèn))
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cellranger
系統(tǒng)配置要求： Linux至少8核（推薦16核） 64GB RAM(推薦128GB)甜孤，最低配的64G允許cellranger aggr合并最多250k個(gè)細(xì)胞 1T硬盤(pán) 64-...
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CellRanger走起(三) 使用初探劉小澤寫(xiě)于19.5.6 首先對(duì)上次改好名稱(chēng)的fastq數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控 然后利用Filezilla下載其中SRR7722937的R1协饲、R2的html，打開(kāi)看下 首先是R1的缴川，這個(gè)...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心把夸，又辜負(fù)了努力
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CellRanger走起(四) Cell Ranger流程概覽劉小澤寫(xiě)于19.5.7主要看流程而线，這一篇不涉及真實(shí)數(shù)據(jù)展示 總的來(lái)說(shuō)，Cell Ranger主要的流程有：拆分?jǐn)?shù)據(jù) mkfastq、細(xì)胞定量 count膀篮、定量組合 aggr嘹狞、...
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下載數(shù)據(jù)
搜索GSEXXX利用prefetch下載數(shù)據(jù) prefetch安裝與使用 aspera安裝 3.數(shù)據(jù)下載 其中Acssesion list 可在GEO-SRA中下載 如果作者...
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CellRanger走起(一)數(shù)據(jù)下載劉小澤寫(xiě)于19.5.3 數(shù)據(jù)來(lái)自2018年9月的NC文章Acquired cancer resistance to combination immunotherapy fro...
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創(chuàng)建新用戶(hù)
以root用戶(hù)登錄useradd -r -m -s /bin/bash [username]ll homecd /homechmod +w sudoersllvi sudoe...
