現(xiàn)在gatk已經(jīng)更新到gatk4了泛源，但是gatk3.8還是有很多應(yīng)用的場(chǎng)景佑惠，比如指定多線程哟楷，并且有些功能在gatk4里找不到（也可能是我道行淺）所以記錄一下之前如何安裝和注冊(cè)...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：河南
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用conda下載安裝gatk3.8并注冊(cè)
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R可視化之ComplexHeatmap【四】：熱圖小方格個(gè)性化修飾嗜诀、提取亞集及熱圖信息特別聲明：本部分（系列）內(nèi)容均來(lái)自顧祖光博士對(duì)ComplexHeatmap的介紹，僅為學(xué)習(xí)交流尖飞，尊重原創(chuàng)琉挖。 熱圖系列我們已經(jīng)有： R可視化之ComplexHeatmap【一】...
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WGS分析筆記（2）—— bwa vs bowtie2更新于2020.10.29 在進(jìn)行正式的mapping記錄之前，先記錄一下bwa與bowtie2在mapping這個(gè)環(huán)節(jié)的情況决摧。 一般對(duì)于WGS結(jié)果的mapping亿蒸，一般推薦...
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Linux Top命令之load average詳解
前言 因?yàn)楣P者面試中被問(wèn)到了這個(gè)問(wèn)題,感覺自己不是很清楚,所以還是整理一下,博客中也有不少講到top命令的,但是幾乎沒(méi)看到有把load average這個(gè)講清楚的,所以還是有...
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服務(wù)器集群與PBS任務(wù)管理系統(tǒng)的常用命令1. 服務(wù)器集群 服務(wù)器集群就是指將很多服務(wù)器集中起來(lái)一起進(jìn)行同一種服務(wù)凑兰，在客戶端看來(lái)就像是只有一個(gè)服務(wù)器，集群可以利用多個(gè)計(jì)算機(jī)進(jìn)行并行計(jì)算從而獲得很高的計(jì)算速度边锁，也可以用...
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如何投遞任務(wù)姑食、監(jiān)控任務(wù)和終止任務(wù)；(user)現(xiàn)有的新服務(wù)器上運(yùn)行程序一定要進(jìn)行任務(wù)投遞茅坛，將程序交由任務(wù)管理系統(tǒng)統(tǒng)一調(diào)度 現(xiàn)有的新服務(wù)器上運(yùn)行程序一定要進(jìn)行任務(wù)投遞音半，將程序交由任務(wù)管理系統(tǒng)統(tǒng)一調(diào)度 現(xiàn)有的新服務(wù)器上運(yùn)行程...
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生信常用數(shù)據(jù)庫(kù)（四）：NR數(shù)據(jù)庫(kù)分類搭建前言 因?yàn)橥暾腘R數(shù)據(jù)庫(kù)下載下來(lái)后數(shù)據(jù)量非常龐大，在我們做序列比對(duì)的時(shí)候贡蓖，尤其是很多很大的序列比對(duì)的時(shí)候曹鸠，特別消耗計(jì)算資源和內(nèi)存，最重要的是很耽誤分析的周期摩梧，因此將NR...
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如何從NT/NR數(shù)據(jù)庫(kù)中提取子庫(kù)最近做有關(guān)小鼠腸道微生物宏基因組物延，遇到兩個(gè)問(wèn)題，一是數(shù)據(jù)量太大仅父，二是宿主污染嚴(yán)重叛薯。 估計(jì)宿主污染至少80%左右，因而就想通過(guò)一些方法笙纤，例如kraken耗溜、bowtie等把宿主污...
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使用SOAPfuse進(jìn)行融合基因的分析
歡迎關(guān)注”生信修煉手冊(cè)”! SOAPfuse是華大開發(fā)的一款，專門針對(duì)human的融合基因進(jìn)行分析的工具省容，項(xiàng)目鏈接如下 http://soap.genomics.org.cn...
