軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時(shí)間序列分析（Pseudot...
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單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實(shí)操 -
單細(xì)胞分析實(shí)錄(13): inferCNV結(jié)合UPhyloplot2分析腫瘤進(jìn)化
這一個(gè)分析锚沸，我目前只在Nature Communications上面看到過兩篇文章，都是2020年發(fā)表的递雀。腫瘤進(jìn)化是單細(xì)胞里面做腫瘤內(nèi)部異質(zhì)性一個(gè)比較創(chuàng)新的角度拉队，我參與的課題...
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系統(tǒng)進(jìn)化樹簡介及構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹學(xué)習(xí)筆記秆乳。 系統(tǒng)進(jìn)化樹簡介 系統(tǒng)進(jìn)化樹（Phylogenetic tree）：用一種類似樹狀分支圖形來概括各節(jié)點(diǎn)之間的進(jìn)化關(guān)系般妙，節(jié)點(diǎn)可以是不同物種纪铺、同一物種不同樣本...
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10X單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析轉(zhuǎn)錄因子的前世今生---scenic相信現(xiàn)在很多童鞋都已經(jīng)分析過了10X單細(xì)胞數(shù)據(jù)了，scenic分析目前也是常見的一種個(gè)性化分析了碟渺，很多同學(xué)都分析過鲜锚， 今天我們溫故而知新，深入理解scenic的分析原理和方法...
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如何優(yōu)雅展示GO富集結(jié)果圖片好像加載不出來苫拍，可移步：https://blog.csdn.net/qq_38774801/article/details/114952565[https://blog....
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GSEA和GSVA芜繁，再也不用去下載gmt文件咯前言 我是在y蜀黍的書里(搜索clusterProfiler book 即可找到)看到了一個(gè)叫msigdbr的包，就是把MsigDB的那些基因集合都R語言化了绒极。那么以后想做G...
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讀《研究是一門藝術(shù)》辛苦地工作骏令，但也有探索的喜悅；有些挫折垄提，但有更多的滿足榔袋；有困惑的時(shí)候，但也有信心一切終會(huì)水到渠成铡俐。 這本書是寫給剛?cè)腴T學(xué)術(shù)行業(yè)的研究生看的凰兑，類似過來人給講一講哪里有糖哪里有坑...
