生存模型的構(gòu)建方法包括：1. Lasso回歸纷责；2. Cox多因素回歸；3. 隨機森林惋鸥；4. 支持向量機 可以把log_rank_test或cox篩選出的基因單獨做模型構(gòu)建猬腰，也...
發(fā)簡信
IP屬地：河北
-
TCGA生存模型的構(gòu)建以及模型預(yù)測和評估 -
免疫組庫數(shù)據(jù)分析1-scRepertoire免疫組庫基礎(chǔ)知識見：單細胞免疫組庫：TCR基因重排原理和TCR測序建庫方法[http://www.reibang.com/p/c4896ffadc46] scReperto...
-
單細胞SCENIC分析原理和流程介紹SCENIC官網(wǎng)：https://rawcdn.githack.com/aertslab/SCENIC/701cc7cc4ac762b91479b3bd2eaf5ad5661...
-
單細胞量化代謝活性-scMetabolism一鸟废、scMetabolism的安裝 scMetabolism是一個R包，用于在單細胞分辨率下量化代謝活性姑荷，目前只適用于物種是人的單細胞數(shù)據(jù)盒延。作者推薦使用seurat的數(shù)據(jù)進行...
-
10X單細胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）基因集打分方法匯總
hello，大家好鼠冕，今天周一添寺，做一個簡單的匯總，主要針對基因集打分懈费，無論是單細胞還是空間计露，基因集打分都很普遍，方法也很多憎乙，我們來總結(jié)一下票罐。 研究背景 在單細胞轉(zhuǎn)錄組測序中，整...
-
單細胞之富集分析-4：分組水平GSVA單細胞富集分析系列： 單細胞之富集分析-1：單細胞GSEA分析流程[http://www.reibang.com/p/00f069cb239c] 單細胞之富集分析-2：批量...
-
腫瘤免疫相關(guān)網(wǎng)頁工具/數(shù)據(jù)庫
這份提綱是為了《醫(yī)學信息學》這門課的期末presentation準備的泞边。因為自己前期收藏了一些數(shù)據(jù)分析的網(wǎng)頁工具该押，所以就順手整理了一下，和大伙兒分享阵谚。掛一漏萬蚕礼，歡迎補充。 腫...
-
使用scRepertoire包進行單細胞免疫組庫數(shù)據(jù)分析簡介 scRepertoire包是由華盛頓大學的Nick Borcherding博士開發(fā)梢什，是一款針對10X V(D)J數(shù)據(jù)的免疫組庫分析工具奠蹬。它可以直接讀取10X cellr...
