發(fā)簡信
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孟德爾隨機化GWAS完整的VCF文件列名都是什么意思大家好捎迫，好久不見芋膘，這個公眾號目前只有我在寫宁昭，所有更新隨心所欲瓷患，想起來什么就發(fā)點啥剔氏，也不為掙錢塑猖，希望能跟大家分享一些自己在生信學習中的感受。 上次我們把完整的vcf數(shù)據(jù)提取出來...
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Meta分析軟件盤點谈跛，做Meta要用哪些軟件羊苟？含meta分析軟件安裝包！書接上回感憾，之前我們在《meta分析的基本步驟是什么蜡励？附實例講解，7步快速見刊策略》文章里詳細給大家介紹了撰寫一篇Meta分析需要經(jīng)過哪些步驟阻桅。 今天我們就從這些步驟入手凉倚，給大...
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GWAS分析-P值和beta值的愛恨相殺 (六)前面已經(jīng)簡單介紹過GWAS的概念，GWAS分析中所用到的文件以及分析流程嫂沉，我們在GWAS分析結(jié)果文件中經(jīng)常會看到beta值和P值稽寒，他們分別代表什么意思？這兩個值又有什么關(guān)系呢...
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集成多組學數(shù)據(jù)的機器學習在生物醫(yī)學中的應(yīng)用集成多組學數(shù)據(jù)的機器學習在生物醫(yī)學中的應(yīng)用大綱 機器學習及生物組學基礎(chǔ)（提前贈送視頻） 學習目標：對機器學習基本概念進行介紹趟章，讓大家對機器學習基本概念有大致了解杏糙。明確機器學習...
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R機器學習：重復抽樣在機器學習模型建立過程中的地位理解
在做機器學習項目的時候，一開始我們會將數(shù)據(jù)集分為訓練集和測試集莽龟，要記住測試集只能用一次蠕嫁，只能用來評估最終最好的模型。如果你反復去使用測試集毯盈，反復測試后從里面挑最好的剃毒，你就是在...
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NHANES連載教程轰豆，輕松解鎖新技能
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散點圖的繪制（spss)一：簡單散點圖（以銷售收入和年輕人人數(shù)為例）（1）步驟：圖形->舊對話框->散點圖->簡單散點圖->定義->加入變量->點擊確定（2）會出現(xiàn)如圖所示界面（按圖中所示加入變量）...
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WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因
WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因 原創(chuàng) 生信技能樹 我在生信技能樹多次寫教程分享WGCNA的實戰(zhàn)細節(jié)胰伍，見： 一文看懂WGCNA 分析(2019更新版)[ht...
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R語言 Logistic回歸~模型構(gòu)建
線性回歸模型是研究連續(xù)型變量與一組自變量之間的關(guān)系。也就是說線性回歸模型的因變量是連續(xù)型變量酸休。如果因變量是分類變量骂租，則是非線性的，此時需要用Logistic回歸斑司，對其發(fā)生概率...
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【GEO數(shù)據(jù)庫挖掘】四抽米、差異分析（limma）、繪圖和富集分析參考代碼在這： 1 差異分析 需要的數(shù)據(jù)：表達矩陣糙置、分組矩陣云茸、差異比較矩陣 至此獲得了差異分析矩陣nrDEG 2 繪圖 2.1 熱圖 可以查看到高表達和低表達的基因。 2.2...
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GSE120974多組學分析復現(xiàn)0.數(shù)據(jù)介紹 這是一篇發(fā)表在Cancer Cell 2019 Sep的文章——Single-Cell Transcriptomics in Medulloblastoma R...
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醫(yī)學小白也可以利用生信快速設(shè)計出一個課題
作為一個既沒有任何經(jīng)費也沒有基礎(chǔ)科研條件的醫(yī)學小白谤饭，需要申請課題标捺，該怎么辦呢？俗話說得好：”辦法總比困難多”揉抵。沒有經(jīng)費亡容、沒有經(jīng)驗的情況下，也能想到并設(shè)計好一個課題冤今，進行申請基...
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apply闺兢、lapply、sapply戏罢、mapply屋谭、tapply函數(shù)
簡介批量處理函數(shù)有很重要的apply族函數(shù)：lapply sapply apply tapply mapply。這些函數(shù)底層通過C實現(xiàn)龟糕，效率比手工遍歷高效桐磁。apply族函數(shù)是...
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堅持文獻閱讀D1（2022-08-20）摘要： 背景：NASH是導致肝移植的重要隱私，現(xiàn)行的多項研究只在評估NASH的潛在治療方法讲岁。法尼醇X受體（farnesoid X receptor, FXR）配體奧尼膽酸（o...
