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導(dǎo)讀 主成分分析（principal component analysis遭赂，PCA）是將多個(gè)變量通過(guò)線性變換以選出較少個(gè)數(shù)重要變量的一種多元統(tǒng)計(jì)分析方法，是常用的數(shù)據(jù)降維手段...

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轉(zhuǎn)自：http://www.bio-info-trainee.com/2043.html 提到normalization很多人都煩了，幾十種方法，而對(duì)于芯片或者其它表達(dá)數(shù)據(jù)來(lái)...

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一. 示例數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 下載：鏈接：https://pan.baidu.com/s/1tKR943efKOn7-TW_892KLg提取碼：wbk6 文件說(shuō)明示例數(shù)據(jù)华畏，其中數(shù)據(jù)均為...

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New knowledge for me: sialic acids: protect cancer cells against innate immune cells ki...

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劉小澤寫(xiě)于2020.5.28Ensemble轉(zhuǎn)Symbol其實(shí)不是這么簡(jiǎn)單唯绍，問(wèn)題百出，需要留意 0 今天遇到一個(gè)需求枝誊，先來(lái)看看 有這樣的四個(gè)文件况芒，每個(gè)文件中都有兩列Ensem...

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忙碌于實(shí)驗(yàn)的一周。寫(xiě)代碼的時(shí)候是只要寫(xiě)代碼就要?jiǎng)幽X子绝骚，最簡(jiǎn)單的讀文件耐版，也是要小小動(dòng)一下腦子。而做實(shí)驗(yàn)的時(shí)候是計(jì)劃實(shí)驗(yàn)的時(shí)候動(dòng)腦子压汪，實(shí)驗(yàn)中機(jī)械操作粪牲，然后實(shí)驗(yàn)失敗的時(shí)候是費(fèi)腦子。...

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之前分析TCGA數(shù)據(jù)都是直接匹配barcode止剖，其規(guī)則懂的不多腺阳。相信有不少同志也有這方面困惑。 這里給出兩份資料穿香，一份是TCGA官方英文介紹亭引，鏈接為https://wiki....

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思路 首先要依據(jù)臨床特征建立分組，無(wú)論是復(fù)發(fā)vs原發(fā)還是TNM分型中的T/N/M皮获。將腫瘤每個(gè)樣本的表型特征焙蚓，與表達(dá)數(shù)據(jù)矩陣一一對(duì)應(yīng)到同一張表格里來(lái)，隨后再用作圖工具出圖洒宝。因?yàn)?..

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TCGA數(shù)據(jù)的另一個(gè)重要的包：RTCGA參考學(xué)習(xí)資料：TCGA之miRNA預(yù)測(cè)臨床表現(xiàn)RTCGA（1） 數(shù)據(jù)概況與數(shù)據(jù)下載RTCGA（2） 數(shù)據(jù)分析與可視化https://w...

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友情提示：一定要有R語(yǔ)言的基礎(chǔ)购公，建議學(xué)習(xí)生信技能樹(shù)的《生信人這樣這樣學(xué)R語(yǔ)言》之后（最好再把中級(jí)20題做完），再來(lái)學(xué)習(xí)本系列視頻雁歌！總的來(lái)說(shuō)宏浩，理解了R語(yǔ)言中級(jí)20題之后，這一塊...

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原題目鏈接：http://www.bio-info-trainee.com/3409.html原答案：http://bio-info-trainee.com/tmp/basi...

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關(guān)于叨叨記賬： 早在半年前丑勤，在微博中看到有人分享叨叨記賬中的聊天記錄。這是一個(gè)以你所設(shè)置的idol的口吻與你聊天的記賬軟件吧趣，不得不說(shuō)開(kāi)發(fā)者很有想法法竞，使用者以聊天的方式記賬，...