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使用wget下載GEO數(shù)據(jù)
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申請(qǐng)Gurobi的license
跑一個(gè)程序的時(shí)候遇到報(bào)錯(cuò)The error message "Model too large for size-limited Gurobi license" or "Mod...
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python模塊intervaltree
參考鏈接：https://pypi.org/project/intervaltree/[https://pypi.org/project/intervaltree/]安裝： ...
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repeat文件下載鏈接
http://labshare.cshl.edu/shares/mhammelllab/www-data/TEtranscripts/TE_GTF/[http://labsh...
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2022-09-22
MetascapeStatistics for Enrichment Analysis | Metascape Blog[http://metascape.org/blog/...
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pacbio數(shù)據(jù)分析isoseq3官網(wǎng)：但是后面有polish這一步IsoSeq/isoseq-clustering.md at master · PacificBiosciences/IsoS...
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CCS vs. CLR Modes參考網(wǎng)址：https://www.ndsu.edu/pubweb/~mcclean/plsc411/Pacific%20Biosciencs%20CCS%20vs%20CLR...
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Ribo-seq資料pipline參考：https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ORFik/inst/doc/Ribo-...
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nanopore 數(shù)據(jù)集查詢在ncbi找nanopore三代數(shù)據(jù)的時(shí)候，首先熟悉一下ncbi數(shù)據(jù)的整理的規(guī)則。參考網(wǎng)址：GEO數(shù)據(jù)庫下載 - 百度文庫 (baidu.com)[https://wenku...
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二代全基因組分析上游分析找到兩個(gè)參考網(wǎng)站，也有一些迷惑的地方痊班，我用的第二個(gè)網(wǎng)站這里主要討論上游分析，下游分析網(wǎng)站中也有對(duì)應(yīng)的腳本摹量，但是這里不過多討論網(wǎng)站一：https://docs.gdc.canc...
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vep docker下使用vcf2maf跑完全基因組前面的pipline涤伐，拿到了vcf文件根據(jù)指示把vcf轉(zhuǎn)化為maf，進(jìn)一步畫圖統(tǒng)計(jì)缨称，使用vcf2maf vcf2maf的git地址為： GitHub - mskc...
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如何下載最新的T2T-CHM13參考基因組2022年3月science發(fā)出一系列了關(guān)于這個(gè)參考基因組的文章 但是怎么下載呢 參考網(wǎng)址： 截至2022年5月凝果，目前的版本有v2.0，v1.1睦尽，v1.0等等 因?yàn)檫@個(gè)測(cè)是一...