Human cell atlas, HCA：https://data.humancellatlas.org/[https://data.humancellatlas.org/...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
-
可能是最全的單細(xì)胞數(shù)據(jù)庫(kù)匯總（2023更新版本）
-
R繪圖(4): 散點(diǎn)圖添加相關(guān)系數(shù)/回歸方程
屬于比較常用的技巧肤粱。下面我用ggplot2內(nèi)置數(shù)據(jù)集進(jìn)行演示： 先來(lái)看一下，僅有散點(diǎn)和擬合線的圖 如果想添加擬合的方程抬驴，可以使用ggpmisc包的stat_poly_eq()...
-
ggplot散點(diǎn)圖加相關(guān)系數(shù)計(jì)算一組數(shù)據(jù)有沒(méi)有相關(guān)性以及相關(guān)程度時(shí)，可以使用cor()缆巧，以及cor.test()計(jì)算顯著性布持，如下所示，我們想計(jì)算這兩種花的長(zhǎng)度有沒(méi)有相關(guān)性陕悬。 我們可以手動(dòng)將計(jì)算的相關(guān)系數(shù)...
-
第2周：RNA-seq數(shù)據(jù)分析最佳實(shí)踐原文來(lái)源：Conesa A, Madrigal P, Tarazona S, et al. A survey of best practices for RNA-seq da...
-
maSigpro建模代碼分析之make.design.matrix前言 之前我們介紹了maSigpro的基本建模方式：分析時(shí)間序列的RNA-seq tool[http://www.reibang.com/p/ad76dcfdf840]题暖，這...
-
【陳巍學(xué)基因-4】單細(xì)胞DNA測(cè)序
歡迎關(guān)注公眾號(hào)：oddxix 自從二代測(cè)序技術(shù)出現(xiàn)，把一次實(shí)驗(yàn)測(cè)許多條DNA序列的這個(gè)難題解決之后墩莫，一次把一個(gè)人的全基因組給測(cè)出來(lái)芙委，最極限的情況，就是樣本量就是少到一個(gè)細(xì)胞狂秦，...
-
55-caret包學(xué)習(xí)：預(yù)處理函數(shù)1灌侣、創(chuàng)建虛擬變量 caret包通過(guò)model.matrix()、dummyVars()或其他方式將因子轉(zhuǎn)換為虛擬變量裂问。dummyVars()可用于從一個(gè)或多個(gè)因子變量生成一個(gè)...
-
58-caret包應(yīng)用簡(jiǎn)短實(shí)例Caret包(即Classification And REgression Training的縮寫)侧啼，包含簡(jiǎn)化復(fù)雜的回歸和分類問(wèn)題模型訓(xùn)練過(guò)程的功能牛柒。 1、導(dǎo)入數(shù)據(jù)并分割數(shù)據(jù)...
-
57-caret包支持訓(xùn)練的模型及其參數(shù)列表
來(lái)源：http://topepo.github.io/caret/available-models.html 模型method 值類型依賴包調(diào)優(yōu)參數(shù)AdaBoost Clas...
