摘要： 常用命令： git init 新建一個空的倉庫 git status 查看狀態(tài)git add . 添加文件 git commit -m '注釋' 提交添加的文件并備注...
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GitHub男人的天堂苛让，你真的玩的轉(zhuǎn)嗎影涉？超強(qiáng)超詳細(xì)GitHub教程
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post-GWAS：使用coloc進(jìn)行共定位分析(Colocalization)
GWAS找到顯著信號位點(diǎn)后淤井，需要解釋顯著信號位點(diǎn)如何影響表型。常見的一個解釋方法是共定位分析胞谭。 主流的共定位分析包括： 1）GWAS和eQTL共定位； 2）GWAS和sQTL...
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SNP連鎖不平衡圖（LD）可視化R包LDheatmap的使用理解SNPs之間的聯(lián)系或連鎖不平衡（LD）模式對于單體型的選擇具有重要作用，然而指郁，對于密集的SNP圖譜，隨著區(qū)域內(nèi)SNPs數(shù)量的增加拷呆，很難直接從復(fù)雜的VCF文件來看出SNPs...
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全基因組關(guān)聯(lián)分析學(xué)習(xí)資料（GWAS tutorial）20210313更新版
時隔一年多闲坎，于今日（20210313）再次更新教程，后續(xù)如果新出教程的話會一直更新茬斧。 同時感謝多年陪伴我成長腰懂、一直默默關(guān)注我的「你們」~ by 「橙子牛奶糖（陳文燕）」 1....
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LD SCore計算基因多效性、遺傳度项秉、遺傳相關(guān)性(the LD Score regression intercept, heritability and genetic correlation)這篇文章是對之前啊啊救救我绣溜，為何我的QQ圖那么飄（全基因組關(guān)聯(lián)分析）這篇文章的一個補(bǔ)坑。 LD SCore除了查看顯著SNP位點(diǎn)對表型是否為基因多效性外伙狐，還額外補(bǔ)充了怎么計算...
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GWAS分析-說人話（2）認(rèn)識文件名前言 認(rèn)識文件名涮毫，這玩意太重要了！行外人看不懂按骸０辗馈！０χ丁Ｖ渫隆！！ 高逼格的東西自己閱讀參考文件了恬叹，我只上最粗暴的候生！～ 尼馬的，給我記好了绽昼，不然在GWAS分析的路上活不下的Ｎㄑ肌！硅确！ ...
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GWAS分析-說人話（3）網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)下載后的處理前言 上天會告訴你那個文件才是需要用的嗎缭付？ 不會！ 但我會Ｑ础（點(diǎn)個贊陷猫，大個賞唄～） 數(shù)據(jù)下載后，相信我的妖，小白連看哪個數(shù)據(jù)都會不知道的绣檬！ 當(dāng)然，數(shù)據(jù)分析的第0章羔味，數(shù)據(jù)下載河咽，也不...
