要找到基因組上特定位置变姨，僅憑標記引物序列盖矫，可以采用以下幾種方法： 利用在線工具進行In-Silico PCR：可以使用UCSC Genome Browser提供的In-Sil...
發(fā)簡信
IP屬地：河南
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如何根據(jù)標記引物序列找到基因組上具體位置？
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R語言的gsub函數(shù)如何做全詞匹配？
在R語言中务蝠，gsub 函數(shù)用于進行全局替換拍谐，但是它默認不區(qū)分單詞邊界。如果你想要進行全詞匹配馏段，即只替換完整的單詞而不是部分匹配的字符串轩拨，你可以使用正則表達式中的單詞邊界 \b...
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Nature Genetics | 歷經(jīng)8年，中德美科學(xué)家聯(lián)合首次發(fā)現(xiàn)玉米根系馴化及環(huán)境適應(yīng)性遺傳機理
2024 年 5 月 22 日 Nature Genetics (doi: 10.1038/s41588-024-01761-3) 發(fā)表論文 ...
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DeepCCR：基于基因組學(xué)的大規(guī)模深度學(xué)習(xí)方法改良水稻育種
近期院喜，中國農(nóng)科院作物所聯(lián)合國內(nèi)多家單位亡蓉，構(gòu)建了用于水稻基因組選擇的大規(guī)模中國栽培稻群體數(shù)據(jù)集，提出了配套的全基因組預(yù)測深度學(xué)習(xí)模型DeepCCR喷舀，為育種者快速砍濒、高效地培育優(yōu)良...
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推薦 | VCF2PCACluster快速實現(xiàn)超大規(guī)模SNP的PCA分析
推薦一個高效做PCA分析的工具，從VCF文件到直接出圖的一鍵式分析硫麻，對于小白非常友好爸邢。小明哥剛開發(fā)時小編就在用了，那時還叫MingPCACluster庶香，今年五月終于發(fā)表見刊甲棍，...
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NAR | 華大和上海師范大學(xué)開發(fā)的基因組選擇平臺CropGS-Hub
幾個月前就聽說華大萬物聯(lián)合上海師范大學(xué)開發(fā)了基因組選擇的工具CropGS，一直比較好奇赶掖。近日文章已經(jīng)發(fā)表見刊感猛，得以一窺究竟。 [圖片上傳失敗...(image-6f067e-...
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又雙叒叕一個大豆T2T基因組發(fā)表了
前不久才剛總結(jié)完大豆T2T基因組：哪個才是首個（中國）大豆的T2T基因組版本奢赂？[https://mp.weixin.qq.com/s/WOJT3pk5SQDI_JKyZ82Z...
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國家生物信息中心和表型組學(xué)研究中心公開植物圖像及相關(guān)性狀開放歸檔庫OPIA
植物圖像承載著豐富的信息陪白，反映了植物的顏色、形態(tài)膳灶、生長和健康狀態(tài)等關(guān)鍵特征咱士。高通量植物表型采集技術(shù)廣泛用于植物表型組學(xué)研究，產(chǎn)生了大量基于圖像的性狀數(shù)據(jù)轧钓，對種質(zhì)篩選序厉、植物病蟲...
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在ProtParam 批量預(yù)測蛋白序列理化性質(zhì)參數(shù)
計算蛋白理化性質(zhì)一般在網(wǎng)站，protparam[https://web.expasy.org/protparam/]此網(wǎng)站只可以一次輸入一條序列毕箍，結(jié)果需要挨個復(fù)制弛房。當序列條數(shù)...
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fastsimcoal基因流和種群歷史動態(tài)可視化解讀參考 大型基因組SLAF-seq蕨類植物孢子強擴散能力下生態(tài)適應(yīng)塑造的遺傳分化格局Ecological adaptation shaped the genetic struc...
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vcf文件中短序列插入缺失（INDEL）標準化問題：INDEL在vcf文件中表示的非唯一特性 INDEL 在Wikipedia中的解釋： Indel is a molecular biology term for an ...
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R語言模型部署方法總結(jié)模型部署概述 數(shù)據(jù)科學(xué)項目的生命周期通常以迭代方式執(zhí)行以下主要階段： 業(yè)務(wù)理解（Business understanding） 數(shù)據(jù)采集和理解（Data acquisitio...
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康奈爾大學(xué)生物信息中心主任關(guān)于基因組組裝報告Dr. Qi Sun是康奈爾大學(xué)高級研究員和生物信息學(xué)中心主任，長期以來從事生物信息學(xué)工作而柑，在大數(shù)據(jù)的管理與分析上文捶，特別是Genotype-By-Sequence (GBS)...