在做生信下游基因分析的時候躯保，我們通常需要下載興趣基因的序列信息構(gòu)建進(jìn)化書什么的缎讼，如果興趣基因比較少，那么可以直接在NCBI上搜索這個基因下載序列蜗顽。但如果興趣基因很多布卡，如果逐個...
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如何在NCBI批量下載基因家族序列？ -
TBtools基因家族分析詳細(xì)教程(3)基因家族成員的進(jìn)化分析2基因-共線性的定義與常見算法原理 物種內(nèi)的共線性分析文件準(zhǔn)備（物種比對到自身的.blast文件，物種基因信息文件.gff文件）雇盖，運行MCScanX忿等，輸出collinear和t...
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TBtools物種間共線性分析使用教程首先非常感謝CJ老師開發(fā)的TBtools工具，給生信分析帶來了極大的便利崔挖，詳細(xì)內(nèi)容介紹請參考http://www.reibang.com/p/f39bff6c4746 一 ...
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實驗1：總RNA的提取——Trizol實驗一：細(xì)胞中總RNA的提取及鑒定 一贸街、目的：掌握Trizol提取總RNA的原理和步驟，學(xué)習(xí)電泳鑒定總RNA的方法狸相。二匾浪、原理：RNA是核酸，具有較好的水溶性卷哩。提取RNA首先破...
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qRT-PCR 計算公式2–ΔΔCT (Livak) 方法當(dāng)我們做到熒光定量實驗時候蛋辈，普遍采用操作簡便的2–ΔΔCT 法。 前提條件： 1. 使用2–ΔΔCT 法之前将谊，必須驗證目標(biāo)基因和參照基因的擴(kuò)增效率冷溶。目標(biāo)基因和參照基因擴(kuò)增效率...
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qRT-PCR實驗及數(shù)據(jù)分析qRT-PCR實驗原理 RT-qPCR由普通PCR技術(shù)發(fā)展而來，它是在傳統(tǒng)PCR反應(yīng)體系中加入熒光化學(xué)物質(zhì)（熒光染料或者熒光探針）尊浓，根據(jù)各自不同的發(fā)光機(jī)制實時檢測PCR退火逞频、...
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qRT-PCR相對定量計算詳解做完轉(zhuǎn)錄組分析之后，一般都要求做qRT-PCR來驗證二代測序得到的轉(zhuǎn)錄本表達(dá)是否可靠栋齿。熒光定量PCR是一種相對表達(dá)定量的方法苗胀，他的計算方法有很多襟诸，常用的相對定量數(shù)據(jù)分析方法有...
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八行代碼搞定內(nèi)參基因篩選-R版本的NormFinder寫在前面 碩士畢業(yè)做的大豆內(nèi)參基因的篩選，當(dāng)時用了geNorm, NormFinder和BestKeeper三個軟件基协，geNorm 不需要多說歌亲，Vandesompele教授的...
