所涉及的函數(shù) Mutating Joins: inner_join(), left_join(), right_join(), full_join() Filtering J...
IP屬地：江蘇
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R語言中dplyr包join函數(shù)之目前我看到過的最形象的教程 -
DNA鏈方向上的小疑惑
雖然是做生物信息的优炬，但是經(jīng)常被一些基礎(chǔ)性概念所困擾……而我又是一個強(qiáng)迫癥，于是把這些亂七八糟的東西整理了一下芙委，強(qiáng)行寫了一篇小文章羞福。東西太雜惕蹄，但是彼此相關(guān)，實在想不到什么合適的...
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TCGA / 癌癥簡稱 / 縮寫 / TCGA癌癥中英文對照
TCGA數(shù)據(jù)庫中含有的癌癥名稱治专，簡寫和中文名稱 Abbr英文名稱中文名稱ACCAdrenocortical carcinoma腎上腺皮質(zhì)癌BLCABladder Urothe...
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從RNA定向互作看基因組組織在過去的幾十年中卖陵，我們逐漸意識到調(diào)節(jié)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的過程的復(fù)雜性。從染色質(zhì)可及性到遠(yuǎn)距離基因組組織张峰，細(xì)胞使用了多種機(jī)制來控制基因表達(dá)泪蔫。我們最近開始了解非編碼RNA（ncR...
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tximport 將 Salmon 定量結(jié)果導(dǎo)入 DESeq2
在《Salmon 進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本定量》[http://www.reibang.com/p/f62fd85113d3]文章介紹了 Salmon 定量。定量后將數(shù)據(jù)導(dǎo)入 DESeq...
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快速計算基因表達(dá)軟件：Salmon我們常見的轉(zhuǎn)錄組表達(dá)分析一般都是將reads比對至參考基因組或者轉(zhuǎn)錄組上喘批，然后在基因或者轉(zhuǎn)錄本水平上定量表達(dá)豐度撩荣。 但最近在做小RNA分析時卻遇到了沒有參考基因組注釋文件（g...
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RNA-seq轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析丨一套完整的案例流程
今天分享的學(xué)習(xí)筆記是一套轉(zhuǎn)錄組分析簡單流程，適用于初學(xué)者入門閱讀饶深，從原始測序數(shù)據(jù)開始餐曹，經(jīng)過質(zhì)控、序列比對敌厘、定量表達(dá)台猴、差異表達(dá)、功能富集等一系列分析步驟俱两，最終獲得基因表達(dá)信息饱狂。...
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RNA-seq(2)-1:原始數(shù)據(jù)下載的幾種方法
How to download All Sra data At Once SRA: Sequence Read Archive: It belongs to NCBI (N...
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有用的UCSC tools推薦
先上網(wǎng)站鏈接，這些都不需要安裝宪彩，直接下載下來就可以用休讳，比較便捷http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/ 1...
