鞏翔宇I(lǐng)brahimovic

主要講述PyMOL中常見的圖形界面（鼠標）操作 1.認識PyMol 1. 軟件界面介紹 1.2 內(nèi)置demo介紹 打開PyMOL,點擊1.1菜單窗口的Wizard菜單伯病，然后點...

小明的數(shù)據(jù)分析筆記本

今天要模仿的圖片來自于論文 Core gut microbial communities are maintained by beneficial interactions ...

小明的數(shù)據(jù)分析筆記本

論文 Microbiome differential abundance methods produce different results across 38 datase...

果蠅飼養(yǎng)員的生信筆記

clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫的R包，看過了它的繪圖就會使人沉迷于其顏值無法自拔搞动。本文很多內(nèi)容直接翻譯自官方文檔，加上了我的測試數(shù)據(jù)（還是以果蠅為例）渣刷。 一鹦肿、...

生信寶庫

說在前面 在國內(nèi)做生信的小伙伴或多或少都聽過一個大名鼎鼎的名字---Y叔涣旨，想當初小編初入生信大門時還專門百度查了一下，他就是南方醫(yī)科大學生物信息學系主任余光創(chuàng)教授股冗。Y叔在國際...

紀偉講測序

對于基因的差異表達譜霹陡，常用熱圖作為展示。但有時差異基因可能非常的多，熱圖中不可能將所有基因的名稱標注出來烹棉。那么此時不妨選擇一些比較重要的基因（比方說p值最顯著的那些）攒霹，在圖中...

沉迷工作的我

當我們畫熱圖（heatmap）的時候浆洗，如果基因的名字比較多的時候催束，在熱圖中展示的話，就會出現(xiàn)名字重疊的情況伏社，針對這個情況抠刺，我們有兩種比較好的解決辦法，第一是在熱圖中僅顯示關(guān)注...

周運來就是我

突然間發(fā)現(xiàn)摘昌，我一做熱圖就用pheatmap幾乎不存在第二個選項了矫付。是時候跑一遍pheatmap的demo了. Examples scale是一個值得注意的參數(shù)，它旨在說明你想...