在單細(xì)胞研究中,最重要的一個環(huán)節(jié)就是細(xì)胞類型注釋族奢,這是一個極其考驗研究者研究背景和精力的工作姥闭,但隨著單細(xì)胞的研究越來越多,可提供給我們的細(xì)胞類型的marker信息也越來越豐富...
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前言 我們知道越走,細(xì)胞間信息傳遞方式一個是細(xì)胞表面配受體的相互作用棚品,另一個通過細(xì)胞產(chǎn)生的可溶性小分子靠欢,即細(xì)胞因子。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中下游铜跑,有時候我們想看某幾種細(xì)胞類型之間的相互...
你好锅纺!這套代碼到2023年5月再運行的時候有好幾處報錯掷空,改怎么解決?
完整的單細(xì)胞分析流程——理解你的單細(xì)胞分析之?dāng)?shù)據(jù)結(jié)構(gòu)背景介紹 Bioconductor項目的主要優(yōu)勢之一在于使用通用數(shù)據(jù)基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)囤锉,該數(shù)據(jù)基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)可實現(xiàn)跨越R包的相互操作性坦弟。 用戶應(yīng)該能夠使用來自不同Bioconductor軟件...
Compiled: May 23, 2023 設(shè)置Seurat對象 對于本教程酿傍,我們將分析來自10X Genomics的一個外周血單個核細(xì)胞(PBMC)數(shù)據(jù)集。該數(shù)據(jù)集包含2...
太開心啦!謝謝小潔老師的鼓勵叉讥!之前自己學(xué)的不踏實窘行,雖然做了很詳細(xì)的筆記,沒有及時的復(fù)習(xí)和真正去理解每個代碼的意思图仓,老師的精髓還沒學(xué)到罐盔,還得好好努力!
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@小潔忘了怎么分身 謝謝老師的指導(dǎo),我試試纬黎。
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小潔老師,前一陣子用了好長時間整理ICGC中RECA-EU的數(shù)據(jù)烛亦,仔細(xì)學(xué)習(xí)了一下老師的代碼诈泼,比我之前自己整理的簡潔好用多了,我把生存信息的整理代碼也重新整理了一下煤禽。這是鏈接:http://www.reibang.com/p/4253a78d806b
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真的是很細(xì)節(jié)硝桩,看了前幾個細(xì)節(jié)感覺好熟悉沿猜,越往后看就更加確定了你是我們的“學(xué)長/學(xué)姐”。這里面的筆記還有很多事延伸的碗脊,很受用啼肩,總結(jié)的特別好。向優(yōu)秀學(xué)員學(xué)習(xí)望薄!
R語言細(xì)節(jié)匯總運行腳本的快捷鍵:cmd+enter (mac) 工作目錄是指腳本疟游、數(shù)據(jù)、圖片的默認(rèn)保存位置痕支,也是文件讀取的默認(rèn)位置颁虐。我們使用project來管理工作目錄 開始一個新的R語言...