發(fā)簡信
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有了這八個網(wǎng)站，幫你找到90%的電子書首先感謝各位的厚愛，許久未來问词，卻得到如此多的支持永高。 所以我又重新篩選了一遍，替換走失網(wǎng)站衔统，新增網(wǎng)友要求的英文網(wǎng)站。 1海雪、鳩摩搜索（https://www.jiumodiary...
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可視化文章集錦(套路锦爵、配色、編輯奥裸、在線工具险掀、R、CIRCOS湾宙、Cytoscape)
數(shù)據(jù)可視化是解析樟氢、理解和展示數(shù)據(jù)不可缺少的一部分冈绊。炫或不炫看個人喜好和功底，能否達意是最基本的要求---最合適的圖示和配色表達最直觀的含義埠啃。 本文整理了關于可視化套路 (什么...
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互聯(lián)網(wǎng)碴开、思維毅该、生活感悟<br>個人主頁：<a href="https://stormsha.com" rel="nofollow" target="_blank">https://stormsha.com</a>
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CSU大三<br>微信公眾號：月小水長（ID:inspurer)<br>交流群：861016679<br>個人網(wǎng)站: <a href="https://inspurer.github.io" rel="nofollow" target="_blank">https://inspurer.github.io</a><br>原創(chuàng)作品眶掌，已授權維權騎士，轉載請私信
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Shiny文檔翻譯-a.02 使用isolate()阻斷響應
翻譯自：Stop reactions with isolate()轉載請注明來源 響應阻斷器：避免依賴 有的時候巴碗，對于一個observer或響應終端而言朴爬，具備訪問響應值或響應...
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發(fā)明者 - 筑就非凡的量化世界
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R語言ggboxplot-一文掌握箱線圖繪制所有細節(jié)作者：白介素2相關閱讀：R語言ggplot2繪制箱線圖R語言生存分析04-Cox比例風險模型診斷R語言生存分析03-Cox比例風險模型R語言生存分析-02-ggforestR...
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從Keras開始掌握深度學習-4 通過TensorBoard分析模型前言 TensorBoard是一個機器學習的可視化工具寝殴，能夠有效地展示Tensorflow在運行過程中的計算圖、各種指標隨著時間的變化趨勢以及訓練中使用到的數(shù)據(jù)信息明垢。通過使用...
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從Keras開始掌握深度學習-5 優(yōu)化你的模型前言 在第3篇教程里面蚣常，我們所編寫的CNN進行分類的模型準確度達到了80%。對于一個分類模型來說痊银，80%的準確率不算很低了抵蚊。但是，在現(xiàn)有的情況下溯革，我們應該如何優(yōu)化這個模型呢贞绳？...
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生信技能樹冈闭，生信菜鳥團，jimmy
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關于ML的模型選擇的驗證集與交叉驗證的疑惑與解答
之前粗略的讀過西瓜書的關于模型的評估與選擇這一章 關于對模型的泛化性評估抖单，以為無非就是分為訓練集和測試集萎攒，分別用來訓練模型以及計算誤差。 再往下看矛绘，什么交叉驗證法耍休、留出法.....
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請問一下FilterMutectCalls后的結果怎么理解，在經(jīng)過這一步處理之后货矮，filter這一項沒有PASS羊精，只有artifact_in_normal;base_quality;clustered_events;panel_of_normals;read_position之類的，出現(xiàn)的最多的是‘.’囚玫，這是什么意思喧锦，是一個位點都沒留下來读规？
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你好，我想請教一下：
1燃少、deepvariant獲得的結果不使用hap.py直接進行下游分析是否可行掖桦，會推薦使用PASS的位點么？
2供汛、如果要用hap.py枪汪，對于全基因組真集應該選擇什么文件，af-only-gnomad.raw.sites.hg19.vcf.gz可否怔昨？
3雀久、另外hap.py獲得的結果filter列都是點號，是否已經(jīng)刪除了它認為找的不正確的位點趁舀？
盼望解答赖捌，非常感謝。DeepVariant — step2 DeepVariant下載及測試
一矮烹、DeepVariant的下載 1.官網(wǎng)推薦步驟 dokcer版本的deep-variant的使用（DeepVariant 的用法 Github上面介紹的很詳細）：http...
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@波若流殤 在deepvariant手冊里找到說不推薦BQSR越庇，會損害deepvariant的準確度，所以我改了策略了奉狈，特此說明卤唉，防止誤導旁人??
DeepVariant — step3 DeepVariant、GATK仁期、Sentieon的比較
找了一組數(shù)據(jù)桑驱，是100個基因的小panel的bam文件，用DeepVariant跛蛋、GATK熬的、Sentieon三個軟件分別call SNP/INDEL，最后做一下比較赊级。bed文...
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感謝博主押框，加深了我的理解，最近在總結原理方面的東西理逊。我覺得第二個步驟應該是預訓練的模型加上已知基因型樣本加上該未知樣本再訓練后獲得的CNN模型橡伞。
另外我想請教一下，deepvariant找的是種系突變還是未加區(qū)分挡鞍？如果想找體細胞突變骑歹，目前是不是只有用GATK4明確指定的工具Mutect2？
盼望解答墨微，謝謝。DeepVariant — step4 DeepVariant 三部曲
Deepvariant是google 推出的基于CNN（convolutional neural network扁掸，卷積神經(jīng)網(wǎng)絡）算法翘县，圖像識別的變異檢測軟件最域。 參考的有關De...
