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2022-05-25甲基化轉(zhuǎn)化率統(tǒng)計
Bisulfitesequencing吃既，實驗 BS 處理 C->U(T) 轉(zhuǎn)化效率并不是 100% 的，轉(zhuǎn)化失敗的部分 C 會成為假陽性信號继阻，所以 BS 轉(zhuǎn)化率也是很重要的指...
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用 spike-in DNA 計算 BS 處理的轉(zhuǎn)化率
WGBS 實驗 BS 處理 C->U(T) 轉(zhuǎn)化效率不是 100% 的，轉(zhuǎn)化失敗的部分 C 會成為假陽性信號原茅，所以 BS 轉(zhuǎn)化率也是很重要的指標(biāo)吭历。計算轉(zhuǎn)化率需要建庫實驗參入已...
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博主您好晌区，我想知道文中所提到的DMR不是本來就是根據(jù)亞群之間得到的差異甲基化區(qū)間嘛，那拿DMR去做pca贝室，好像本來就能分出亞群來吧契讲。有點沒太理解這里做pca的目的，謝謝~
利用DMR進(jìn)行PCA分析
使用DMR進(jìn)行PCA的主要目的是為了探究亞群中DMR是否存在大的差異滑频，可以將不同亞群分開捡偏。因為我們知道DMR在植物中存在三種類型CG、CHG和CHH峡迷，那么我們就需要對三種甲基...
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@Jason數(shù)據(jù)分析生信教室 明白了银伟，謝謝您你虹！
用R語言對vcf文件進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘.7 測序深度覆蓋度
目錄 前言[http://www.reibang.com/p/729673778e43] 方法簡介[http://www.reibang.com/p/d9bd081763...
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您好，我想請問一下SNP的GT一欄如果是0/0的話彤避，那不是代表基因型和reference的是一樣嗎傅物，為什么0/0的位點也是SNP呢？望指教琉预，謝謝董饰！
用R語言對vcf文件進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘.7 測序深度覆蓋度
目錄 前言[http://www.reibang.com/p/729673778e43] 方法簡介[http://www.reibang.com/p/d9bd081763...
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circos circlize ggbio gviz 等
