練習(xí)數(shù)據(jù)集的GEO編號：GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
IP屬地：湖南
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多個10x單細胞對象的合并和批次校正--seurat錨點整合+Harmony -
scRNAseq || 堆疊小提琴圖(StackedVlnPlot)的4種實現(xiàn)方式??最近一直在學(xué)習(xí)單細胞方面的知識屯烦，無意中看到別人的帖子在分享如何畫堆疊的小提琴圖(StackedVlnPlot)履羞，順便就學(xué)習(xí)了一下。發(fā)現(xiàn)StackedVlnPlot圖確實看...
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pheatmap函數(shù)error
用pheatmap函數(shù)在Linux系統(tǒng)上畫圖 輸入數(shù)據(jù)格式：如下 p2=pheatmap(marker,cluster_cols = T,cluster_rows = T,c...
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單細胞T-cell 文章錦集（做ppt用）張澤民老師課題組單細胞系列文章觀看順序指南 下面是同期收集單細胞Tcell 的文章售葡，以饗讀者。 SnapShot: T Cell Exhaustion T cells: th...
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單細胞轉(zhuǎn)錄組亞群分析
作者：堯小飛審稿：童蒙編輯：angelica 引言 在上一篇文章單細胞轉(zhuǎn)錄組(Single cell RNA)概述钧舌，我們對單細胞轉(zhuǎn)錄組進行了簡單的介紹及其分析必備所需矩陣的獲...
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R--去重unique ; duplicated翁狐，根據(jù)某一列的重復(fù)值糙及，去除該重復(fù)值所在的整行
unique 語法 unique(x, incomparables = FALSE, fromLast = FALSE,nmax = NA...)x 可以是向量付翁、數(shù)據(jù)框尖阔、數(shù)組...
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劉小澤學(xué)習(xí)組合多個單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)劉小澤寫于19.10.8前幾天單細胞天地推送了一篇整合scRNA數(shù)據(jù)的文章：使用seurat3的merge功能整合8個10X單細胞轉(zhuǎn)錄組樣本這次根據(jù)推送贮缅，再結(jié)合自己的理解寫一...
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單細胞測序（scRNA-seq）通關(guān)||數(shù)據(jù)處理必知必會單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系列教程 sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...
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桑基圖在單細胞數(shù)據(jù)探索中的應(yīng)用什么是山槿矗基圖 汕垂基圖（Sankey diagram），即沙菘溃基能量分流圖桂肌，也叫桑基能量平衡圖永淌。它是一種特定類型的流程圖崎场，圖中延伸的分支的寬度對應(yīng)數(shù)據(jù)流量的大小，比較適用于用戶流...
