偶然發(fā)現(xiàn)2021年9月底10月初lefse基于python3版本重構(gòu)了，意味著不用再為了兼容語(yǔ)法和包不斷的找python2的資源了（喜大普奔７鞣狻０！）附井，接下來(lái)看一下重構(gòu)后的le...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：甘肅
-
lefse安裝與運(yùn)行-lefse基于python3重構(gòu)后的版本（實(shí)在是好消息） -
使用fastp進(jìn)行數(shù)據(jù)質(zhì)控
fastp是一款較新的數(shù)據(jù)質(zhì)控軟件稚晚，接觸這個(gè)軟件也是由于目前市場(chǎng)的軟件各有功能但是功能都不是很全绎巨，譬如最近接觸到一個(gè)RNAseq數(shù)據(jù)做祝，質(zhì)量較差砾省，需要去除接頭而且含N較多，序列...
-
R 數(shù)據(jù)可視化 —— circlize 簡(jiǎn)單介紹介紹 圓形布局圖非常適合表示復(fù)雜信息混槐，其中最有名的軟件當(dāng)屬 Circos编兄，我們也介紹過(guò) Circos 的配置文件方法。 雖然 Circos 軟件很好用声登，但是它使用的是 per...
-
一套比較簡(jiǎn)便的基因組組裝流程
這套流程主要特點(diǎn)是消耗資源比較少狠鸳，1G以?xún)?nèi)的基因組，內(nèi)存不要低于128G悯嗓，最好能搞到256G件舵，但是再多對(duì)這套流程用不上，更大的基因組沒(méi)有測(cè)試過(guò)脯厨。 測(cè)序數(shù)據(jù)為100x以上的Pa...
