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構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹主要有四種方法:ML、NJ、MP和BI梦碗。 與ML和NJ相比,BI的方法效率更高,已有的研究結(jié)果顯示,對(duì)于同一組數(shù)據(jù)的分析,貝葉斯方法分析結(jié)果中的節(jié)點(diǎn)支持率高于其...
dn/ds又叫ka/ks叉弦,具體的概念丐一,意義百度上都有。現(xiàn)主要介紹最近用到的三種計(jì)算途徑淹冰,分別是maga7库车,datamonkey,paml樱拴。 做選擇壓力分析的序列文件柠衍,需要先c...
1.genome survey 數(shù)據(jù)過濾去除測序原始數(shù)據(jù)中可能包含低質(zhì)量、接頭污染以及含 N 過高的 reads NT比對(duì)通過BLAST對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)過濾后的有效數(shù)據(jù)進(jìn)行 NT ...
基因組組裝完成后晶乔,或者是完成了草圖珍坊,就不可避免遇到一個(gè)問題,需要對(duì)基因組序列進(jìn)行注釋正罢。注釋之前首先得構(gòu)建基因模型阵漏,有三種策略: 從頭注釋(de novo prediction...
Google的chrome莫名其妙突然所有頁面都顯示“喔唷 崩潰啦”翻具,各種插件在右下角彈出報(bào)錯(cuò)履怯!這個(gè)問題我之前遇到過一次,后來通過改快捷方式的名字解決了裆泳√局蓿可是這次,隔離回來上...
ORF(開放閱讀框)最好被視為蛋白質(zhì)編碼區(qū)的假設(shè)工禾。它是起始密碼子和下一個(gè)終止??密碼子之間的DNA片段运提。它不是真核生物中整個(gè)蛋白質(zhì)編碼區(qū)的假設(shè)(由于內(nèi)含子)。CDS應(yīng)該是整個(gè)...