在做單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的時候植榕，獲得分群后我們希望知道每個群的marker基因是什么以此來描述細胞群的特征高诺。其技術(shù)本質(zhì)就是利用某種規(guī)則獲得樣本（高変基因）或者每個亞群（差異基...
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單細胞轉(zhuǎn)錄組WGCNA到底應(yīng)該怎么做肪获？ -
加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析 (WGCNA）| 共表達網(wǎng)絡(luò)模塊構(gòu)建 |生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析必備技能一趴樱、前言 1.1 概念 加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用來描述不同樣品之間基因關(guān)聯(lián)模式...
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[跟著NC學(xué)作圖]--箱線圖本期內(nèi)容為[跟著NC學(xué)作圖]--箱線圖（一個函數(shù)獲得Mean孝宗、SD厢洞、P值）-- 箱線圖我們在以前的教程中分享過祠挫，但是計算P值和差異性感覺還是比較復(fù)雜的。我們今天看看發(fā)表在NC...
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2022-10-28記錄我在做cellchat的時候遇到的Error Code##1 cellchat <- computeNetSimilarity(cellchat, type = "structural") cellchat <- netEmbe...
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復(fù)現(xiàn)SCI論文圖表：棒棒糖圖|漸變|legeng設(shè)置有小伙伴在群里咨詢了一個圖的做法洞豁，如下： （Reference：GRB10 and E2F3 as Diagnostic Markers of Osteoarthritis ...
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【R】一條命令搞定相關(guān)性圖前面小編給大家講解過 ?R計算多個向量兩兩之間相關(guān)性[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3...
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一個輕量級繪制熱圖的R包-HeatmapR
目前R中繪制熱圖的方式有很多盐固，常用的如pheatmap荒给、ComplexHeatmap包等丈挟，這里再給大家介紹一個輕量級的R包-HeatmapR包，即無需過多的前期數(shù)據(jù)處理志电，可同...
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單細胞分析：細胞聚類（十）導(dǎo)讀 前面我們已經(jīng)整合了高質(zhì)量的細胞曙咽，現(xiàn)在我們想知道細胞群中存在的不同細胞類型 ，因此下面將進行細胞聚類分析挑辆。 學(xué)習(xí)目標(biāo) 描述評估用于聚類的主成分數(shù)量的方法 根據(jù)重要的主成分...
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【R畫圖學(xué)習(xí)15】啞鈴圖啞鈴圖例朱，又叫做棒棒糖圖。因其形狀和棒棒糖相似而得名鱼蝉，具體來看實際上是一個散點和一條線段的組合洒嗤。棒棒糖圖是散點圖的一種變體，又與柱狀圖非常相似魁亦，但其在清晰展示數(shù)據(jù)的同時渔隶，減少了...
