使用R進(jìn)行數(shù)據(jù)分析的時(shí)候煌恢，我們輸入的數(shù)據(jù)大多為寬數(shù)據(jù)悲没，為了適應(yīng)R數(shù)據(jù)的作圖要求蔫骂，需要將寬數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)變?yōu)殚L(zhǎng)數(shù)據(jù)效诅。應(yīng)該說(shuō)這是長(zhǎng)寬數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)變的重要原因之一口叙。 什么是長(zhǎng)數(shù)據(jù)長(zhǎng)數(shù)據(jù)一般是指數(shù)...
說(shuō)在前面 很多人對(duì)科研的第一感覺(jué)就是枯燥江锨、無(wú)聊贞言，甚至還有點(diǎn)費(fèi)頭發(fā)斜棚。其實(shí)，科研有科研的樂(lè)趣该窗，只需要你從中發(fā)現(xiàn)樂(lè)趣弟蚀。今天，Immugent不講難以理解的代碼酗失，也不講枯燥無(wú)味的學(xué)術(shù)...
前言 本次主要使用Seurat比較STAR與Cellranger的輸出結(jié)果义钉，只會(huì)進(jìn)行簡(jiǎn)單的聚類工作。 數(shù)據(jù)讀入 數(shù)據(jù)比較 根據(jù)箱線圖规肴，直方圖和矩陣的基本信息捶闸，可以看到STAR...
劉小澤寫(xiě)于19.2.21或許這還是個(gè)比較常用的需求 我們做轉(zhuǎn)錄組分析，得到的結(jié)果可能是FPKM删壮。但是FPKM確實(shí)存在不準(zhǔn)確性斩启，推薦使用TPM。 read count和FPKM...
最近在學(xué)習(xí)芬蘭CSC-IT科學(xué)中心主講的生物信息課程(https://www.csc.fi/web/training/-/scrnaseq)視頻醉锅，官網(wǎng)上還提供了練習(xí)素材以及詳...
ggplot2 colors : How to change colors automatically and manually? ggplot2 ：如何自動(dòng)和手動(dòng)更改顏色兔簇？...
處理數(shù)據(jù)list 類似地，導(dǎo)入 #上調(diào)數(shù)據(jù) #全部數(shù)據(jù) 然后可以做成表硬耍，寫(xiě)出數(shù)據(jù)后分別查看1U2,1U2U3集合內(nèi)容 繪制Venn圖 分別得到一張上調(diào)Venn圖和一張下調(diào)Ve...
最近幾日，我一直在寫(xiě)抵制丑書(shū)的文章经柴，很多網(wǎng)友紛紛表示贊同狸窘， 但很多所謂的“書(shū)法家”之言：什么是丑書(shū)，你懂嗎坯认？指責(zé)我不懂得欣賞翻擒，沒(méi)有藝術(shù)細(xì)胞卻要“詆毀”他們所謂的“行為藝術(shù) 其...
