總結(jié) 準(zhǔn)備工作： 設(shè)置工作目錄昵济，用pymol去除水分子逼蒙，分離蛋白和小分子，得到各自的pdb文件吓坚。 （如果是預(yù)測(cè)得到的蛋白pdb撵幽，那就直接拿來(lái)用咯，如果是已知結(jié)構(gòu)可從pdb數(shù)據(jù)...
IP屬地：山西
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理解autodock分子對(duì)接思路和流程
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分子對(duì)接軟件-vina1礁击，簡(jiǎn)介 Vina由美國(guó) The Scripps Research Institute的Dr. Oleg Trott設(shè)計(jì)創(chuàng)立盐杂，全稱為AutoDock Vina。網(wǎng)站：http...
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Autodock分子對(duì)接完結(jié)&總結(jié)1.Grid （1） 打開(kāi)蛋白哆窿，“Grid->Macromocule->Open”链烈，打開(kāi)“r.pdbqt”。彈出的對(duì)話框挚躯，點(diǎn)擊Yes及確定 （2） 打開(kāi)小分子强衡，“Grid->...
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2020-02-08 根據(jù)DAVID結(jié)果做圖GOterm分析
##根據(jù)DAVID結(jié)果做圖GOterm分析，數(shù)據(jù)格式從DAVID中下載码荔，先保存至txt,后用excel打開(kāi)漩勤，再保存為CSV格式 x<-read.csv(file = "C:\...
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DAVID數(shù)據(jù)制作KEGG的氣泡圖和柱狀圖DAVID數(shù)據(jù)制作KEGG的氣泡圖和柱狀圖 rm(list=ls()) library(ggplot2) library(Cairo) setwd("C:\\Users\\w...
