最近有小伙伴私信我，如下的單細(xì)胞UMAP圖怎么做螃诅？是啥樣的圖呢啡氢？就是UMAP圖上其他群是灰色的始腾，只有某個(gè)群或者某幾個(gè)群是標(biāo)記顏色的，比較突出空执。其實(shí)很簡(jiǎn)單浪箭，一種辦法可參考我們之...
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單細(xì)胞UMAP圖只標(biāo)記特定細(xì)胞群辆脸、圈定細(xì)胞群及坐標(biāo)軸修改
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滿足你的碩士畢業(yè)論文小套路---蛋白結(jié)構(gòu)與功能和疾病關(guān)系的生信分析完整套路
目前，許多學(xué)校的碩士畢業(yè)論文要求都是發(fā)表一篇中文核心論文辨绊，便能達(dá)到畢業(yè)小論文考核奶栖。針對(duì)小論文的發(fā)表，有的同學(xué)要么是因?yàn)檎n題難度有些大门坷，沒(méi)有摸好合適的濃度宣鄙，實(shí)驗(yàn)結(jié)果不理想。...
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單細(xì)胞測(cè)序（sc-RNA seq）分析：Seurat4.0系列教程默蚌、高級(jí)分析冻晤、文章復(fù)現(xiàn)
時(shí)代的洪流奔涌而至，單細(xì)胞技術(shù)也從舊時(shí)王謝堂前燕绸吸，飛入尋常百姓家鼻弧。雪崩的時(shí)候，沒(méi)有一片雪花是無(wú)辜的锦茁，你我也從素不相識(shí)攘轩，到被一起卷入單細(xì)胞天地。R語(yǔ)言和Seurat已以勢(shì)如破竹...
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)中到底應(yīng)該如何處理線粒體基因
什么是線粒體基因 線粒體是參與細(xì)胞凋亡啟動(dòng)和執(zhí)行的主要細(xì)胞器之一码俩。線粒體基因在大多數(shù)細(xì)胞中表達(dá)度帮，其表達(dá)水平是細(xì)胞類型特異性的。也就是說(shuō)這個(gè)也是和細(xì)胞類型及其狀態(tài)有關(guān)系的稿存。 為...
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轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)七（差異基因分析）
轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)一（軟件安裝） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)二（數(shù)據(jù)下載） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)三（數(shù)據(jù)質(zhì)控） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)四（參考基因組及gtf注釋探究） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)五（reads的比對(duì)與samtoo...
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1.轉(zhuǎn)錄組 | 上游分析（數(shù)據(jù)下載笨篷，比對(duì)，計(jì)數(shù)）參考：轉(zhuǎn)錄組分析記錄瓣履； 轉(zhuǎn)錄組入門和進(jìn)階以下內(nèi)容為轉(zhuǎn)錄組全部的上游分析率翅，包括下載數(shù)據(jù)、比對(duì)拂苹、計(jì)數(shù)得到表達(dá)矩陣安聘。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo...
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轉(zhuǎn)錄組RNA-SEQ上游分析2020安裝配置conda 使用清華源下載sh腳本并安裝 下載完成后直接運(yùn)行腳本文件bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh。需要輸入yes然后等...
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RNAseq007 轉(zhuǎn)錄組入門上游分析全流程
傳送門： RNAseq006 轉(zhuǎn)錄組入門(6)：reads計(jì)數(shù)RNAseq005 轉(zhuǎn)錄組入門(5)：序列比對(duì)RNAseq004 轉(zhuǎn)錄組入門(4)：參考基因組下載RNAseq0...
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RNA-seq 數(shù)據(jù)分析最佳實(shí)戰(zhàn)（綜述）知識(shí)的學(xué)習(xí)沒(méi)有一蹴而就瓢棒，沒(méi)有捷近浴韭，扎實(shí)的學(xué)習(xí)是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的綜述脯宿，全面而詳細(xì)念颈！深度好文，可用來(lái)反復(fù)閱讀连霉。初學(xué)者用于把握RNA-seq真?zhèn)€流程及各個(gè)...
