在做完GO富集[http://www.reibang.com/p/71278efdaad9]之后笙僚，我們可以得到這樣的富集分析結(jié)果掂恕，在結(jié)果里可以看到有兩列是GeneRatio...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江蘇
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富集倍數(shù)Fold Enrichment的計(jì)算方法 -
@11103749e3d7 請(qǐng)問(wèn)您解決了嗎拣播，我也找不到
【基因組注釋】ncRNA注釋
1. ncRNA 非編碼RNA(Non-coding RNA, ncRNA) 包括rRNA，tRNA，snRNA标沪，snoRNA 和microRNA 等不編碼蛋白質(zhì)的RNA，它...
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中科院碩博生一枚，用簡(jiǎn)書來(lái)記錄自己精讀paper和學(xué)習(xí)生信的過(guò)程吕嘀。
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JCVI(MCscan Python version)使用記錄文章僅是記錄自己的學(xué)習(xí)使用军浆，有錯(cuò)誤請(qǐng)指出，我立刻改正挡闰！ 官方說(shuō)明https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-...
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@斬毛毛 是的是的摄悯！感謝赞季！
GeneMark-ES/ET安裝與模型訓(xùn)練
GeneMarkGeorgia Institute of Technology開(kāi)發(fā)的一系列基因預(yù)測(cè)工具。真核生物基因組預(yù)測(cè)主要會(huì)用到GeneMark-ES/ET, 其中Gen...
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請(qǐng)教一下老師奢驯，用genemark軟件結(jié)果輸入maker為什么會(huì)報(bào)錯(cuò)呢
You have failed to provide a value for 'gmhmme3' in the control files
You have failed to provide a value for 'probuild' in the control files.GeneMark-ES/ET安裝與模型訓(xùn)練
GeneMarkGeorgia Institute of Technology開(kāi)發(fā)的一系列基因預(yù)測(cè)工具申钩。真核生物基因組預(yù)測(cè)主要會(huì)用到GeneMark-ES/ET, 其中Gen...
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同問(wèn)第2個(gè)模塊一直找不到怎么解決呢
安裝GeneMark-ET遇到的錯(cuò)誤
在安裝GeneMark-ET軟件時(shí)：一直卡在以下錯(cuò)誤中 Can't locate Hash/Merge.pm in @INC (you may need to install...
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如何對(duì)基因組序列進(jìn)行注釋基因組組裝完成后轩缤，或者是完成了草圖，就不可避免遇到一個(gè)問(wèn)題贩绕，需要對(duì)基因組序列進(jìn)行注釋火的。注釋之前首先得構(gòu)建基因模型，有三種策略： 從頭注釋(de novo prediction...
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基因組結(jié)構(gòu)注釋軟件列表
基因組結(jié)構(gòu)注釋主要包括三個(gè)方面：從頭注釋（de novo prediction）淑倾、同源注釋（homology-based prediction）以及基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)注釋（tra...
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使用hisat2+stringtie進(jìn)行基因預(yù)測(cè)
比對(duì)到轉(zhuǎn)錄本馏鹤，預(yù)測(cè)基因 使用TransDecoder將結(jié)果整理成evm輸入格式 第一步整理后：
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SNP數(shù)據(jù)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)大概是長(zhǎng)期的不鍛煉使得今天的爬山運(yùn)動(dòng)過(guò)量了，接著悲劇就是無(wú)法入眠娇哆。也幸虧明天是周日湃累，干脆就起床碼字了“郑總結(jié)下自己前面用snp構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的方法吧治力。 1.構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)的算法 構(gòu)...
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請(qǐng)問(wèn)老師，如果預(yù)測(cè)出的基因數(shù)目遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于已發(fā)表文章中的數(shù)目勃黍，模型方面有哪些可以調(diào)整宵统？
使用MAKER進(jìn)行基因注釋(高級(jí)篇之AUGUSTUS模型訓(xùn)練）
準(zhǔn)備訓(xùn)練集和測(cè)試集 根據(jù)Augutus的官方教程，可靠的基因結(jié)構(gòu)序列的要求如下： 提供基因的編碼部分覆获，包含上游幾KB马澈。通常而言瓢省，基因越多，效果越好痊班，至少準(zhǔn)備200個(gè)基因以上勤婚。...
