前兩天釋放了一個插件篇梭，名為「CLI Program Wrapper Creator」笆制，可用于打包所有軟件氮墨，腳本程序，分析流程為「界面化工具」栗弟。打包「界面化工具」污筷，益處如下： ...
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視頻 | 無需編程火惊！手把手教你制作「界面化軟件」，打包所有可用軟件侵贵、python/perl/R腳本 -
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GTF處理腳本 - GTFtoolsGTFtools：一個靈活而強大的GTF文件處理工具 GTFtools是一款用Python編寫的命令行工具，專門用于處理基因轉(zhuǎn)錄格式（GTF）文件乍赫。GTF文件是一種用于描述基...
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即日起「TBtools」關(guān)閉「高速插件商店」瓣蛀，讓往事隨風(fēng)~終于還是走到這一步陆蟆，思來索去，我還是決定惋增，直接「關(guān)閉」TBtools的「高速插件商店」叠殷。當(dāng)然，這對應(yīng)了兩個事情： TBtools 插件商店中又少了一個條目诈皿×质「高速插件商店」本...
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Minimap2（2.20）使用記錄
文章僅是記錄自己的學(xué)習(xí)使用，有錯誤請指出稽亏，我立刻改正壶冒！ 官方說明：https://github.com/lh3/minimap2#general[https://github...
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FTN征文大賽 |簡書鉆變現(xiàn)步驟圖解（滿幣）接上一篇 1.簡書鉆轉(zhuǎn)換步驟圖解 2-1.簡書鉆變現(xiàn)步驟圖解（幣虎） 滿幣交易所 滿幣交易所網(wǎng)站地址 FTN征文大賽傳送門 簡書鉆快速獲取通道
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TCGA所有projects的信息
點擊查看，可以下載到自己本地 TCGA_projects:https://docs.qq.com/document/DYmtyanJwa3RDeW9T[https://doc...
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R包TCGAbiolinks獲取TCGA所有projects的信息可以使用 R 包 TCGAbiolinks 來獲取 TCGA 癌癥臨床信息 信息保存在projects.xlsx文件中措左，查看projects.xlsx (部分內(nèi)容預(yù)覽)：我保...
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awk 中的 BEGIN 和 END 的用法
awk中兩個特別的表達(dá)式依痊，BEGIN和END避除。 這兩者都可用于pattern中怎披，提供BEGIN和END的作用是給程序賦予初始狀態(tài)和在程序結(jié)束之后執(zhí)行一些掃尾的工作。 任何在B...
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【Seurat 官方教程】流程拆解 (一): 預(yù)處理（過濾細(xì)胞和標(biāo)準(zhǔn)化）
官網(wǎng)教程：外周血單個核細(xì)胞數(shù)據(jù)集 Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC)[https://satijalab.org/seurat...
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Orthofinder 2.3Homolog是同源基因瓶摆。 Orthologs,Orthologues 直系同源凉逛，是指不同物種之間的基因，起源于共同的祖先群井，基因功能可能一樣状飞，但又因為進(jìn)化的關(guān)系，使得功能有...
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差異可變剪接軟件哪家強书斜？
作者： 童 蒙編輯：amethyst 可變剪接作為轉(zhuǎn)錄后修飾的重要環(huán)節(jié)诬辈，對細(xì)胞的活性和疾病的發(fā)生發(fā)展都有廣泛的作用。盡管目前軟件很多荐吉，但是軟件間的比較卻比較少焙糟。作者系統(tǒng)地...
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終止釋放-20210320 - Free！公益釋放 | 任何人都能分析 RNAseq 原始數(shù)據(jù)了样屠，只要你用 TBtools 穿撮！寫在前面 六年前，我著實開發(fā) TBtools 的主要目的之一痪欲，即“減輕科研人員數(shù)據(jù)分析負(fù)擔(dān)”悦穿，而后慢慢變化成現(xiàn)在的“降低甚至拆除部分生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析門檻”∫堤撸基于這三五年的觀...
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如何將簡單的問題整復(fù)雜……fasta序列長度篩選寫在前面 看到一個問題栗柒，如何篩選fasta文件中基因序列長度，當(dāng)時腦子里想到了最近正在學(xué)的東西知举。如何在linux下一行指令篩選fasta文件中序列長度低于200的序列瞬沦。 命令...
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基因家族鑒定流程（二） 用blast深员、mmseqs、diamond蛙埂、hmmer搜索同源蛋白本文章將介紹 ①類blast軟件blast倦畅、mmseqs、diamond绣的、hmmer的比較 ②blast叠赐、mmseqs、diamond屡江、hmmer的使用 ③用四種軟件的實踐操...