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PPI 分析蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用（protein-protein interaction, PPI）是指兩個(gè)或兩個(gè)以上的蛋白質(zhì)分子通過非共價(jià)鍵形成蛋白質(zhì)復(fù)合體（protein comp...
IP屬地：寧夏
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一直說自己有一個(gè)文字工作者的夢想，可一直都沒有付出具體的行動伦仍，簡直像騙子一般自欺欺人<br><br>成為一個(gè)對自己有要求的內(nèi)容產(chǎn)出者吧结窘，多做事多輸出機(jī)會會更多一些<br><br>自由地書寫表達(dá)創(chuàng)造記錄個(gè)人成長<br><br>做一些自己感興趣的課題，有邏輯有條理的把一件事情講清楚說明白充蓝，寫你最想寫的隧枫，分享你最想想分享的，做一個(gè)有情趣的創(chuàng)作干貨博主<br><br>變得更有智慧的故事是一首自由的史詩：為了智慧谓苟，你必須先越獄官脓，但在越獄之前，你必須首先意識到你是一個(gè)囚徒娜谊。
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基礎(chǔ)知識 軟件使用 圖表制作 數(shù)據(jù)分析 相關(guān)文獻(xiàn)等
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收錄生物信息分析工具歧譬、方法、思路以及基礎(chǔ)知識等內(nèi)容
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一些生物信息學(xué)用到的軟件，工具璧眠，介紹用法安裝以及以及應(yīng)用的文章 ?? 測序組裝使用的Spades缩焦、canu等等 ?? 序列比對比如blast、bowtie责静、diamond等 ?? 多序列比對比如mega袁滥、clustalW、matff等 ?? 序列格式轉(zhuǎn)化的samtools灾螃、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS题翻、MISO ?? 微衛(wèi)星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻(xiàn)下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進(jìn)化樹構(gòu)建工具IQtree、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL腰鬼、OrthoFinder等 ?? 尋找測序中的結(jié)構(gòu)變異或者SNP序列GATK嵌赠、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o靴拱、QIMME ?? 測序質(zhì)量評估的FastQC、BUSCO猾普、QUAST ?? 可視化工具比如IGV、3D Genome ?? 測序數(shù)據(jù)下載工具SRA Toolkit本谜、ascp等 ?? 數(shù)據(jù)可視化的工具circos 等等
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生信學(xué)習(xí)筆記乌助、腳本編程溜在、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、數(shù)據(jù)分析 ～～～ 生物信息領(lǐng)域的大雜燴～ 好大一鍋亂燉他托，快到我的額碗里來～ 好好學(xué)習(xí)掖肋，天天學(xué)生信～
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生物信息學(xué)（Bioinformatics）是一門交叉科學(xué)志笼，它包含了生物信息的獲取、加工把篓、存儲纫溃、分配、分析韧掩、解釋等在內(nèi)的所有方面紊浩，它綜合運(yùn)用數(shù)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)和生物學(xué)的各種工具疗锐，來闡明和理解大量生物數(shù)據(jù)所包含的生物學(xué)意義坊谁。它隨1990年人類基因組計(jì)劃（HGP）的實(shí)施和信息技術(shù)的發(fā)展而誕生，現(xiàn)已迅速發(fā)展成為當(dāng)今生命科學(xué)最具吸引力和重大的前沿領(lǐng)域滑臊，為生物學(xué)口芍、計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)學(xué)简珠、信息科學(xué)等專業(yè)的高素質(zhì)人才提供了更廣闊的發(fā)展天地
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章聋庵。感謝這些簡友整理的生信分析流程膘融！ 如果簡友投稿沒有被我收入專題，可能是我沒看到或者收入到其他針對性更強(qiáng)的專題中了祭玉。望見諒氧映！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時(shí)候請點(diǎn)擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看脱货。 ?? 全基因組測序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq岛都、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖律姨、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl臼疫、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用择份，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫的使用 ?? 另外就是整個(gè)文章走下來的流程 ?? ?? ??
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生物信息學(xué)軟件，perl鸽斟、python拔创、R、shell腳本交流分享
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