寫(xiě)在前面 做基因功能的人都會(huì)特別注意基因上有什么功能結(jié)構(gòu)域众旗，通常我們認(rèn)為睬辐，結(jié)構(gòu)域決定了這個(gè)基因的功能椭更。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展荞估，我們完全可以通過(guò)一級(jí)序列來(lái)預(yù)測(cè)該基因的結(jié)構(gòu)域嘱兼，...
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【HMMSCAN】使用pfam數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)多序列文件進(jìn)行結(jié)構(gòu)域注釋
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轉(zhuǎn)座子（TE,散在重復(fù)）特征及其對(duì)基因組影響基因組中重復(fù)序列大體分為兩類：串聯(lián)重復(fù)（Tandem repeats成艘，Tandem Duplication） （TRF可預(yù)測(cè)）散在重復(fù)（Dispersed repeats）爪飘，...
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R數(shù)據(jù)可視化21:Edge Bundling圖N久沒(méi)有更新了，最近一段時(shí)間有點(diǎn)繁忙脱篙。今天娇钱，一起來(lái)學(xué)習(xí)一下一個(gè)和Circo圖差不多的圖：Edge Bunding圖（不知道中文咋翻譯）。其實(shí)在我看來(lái)都只是不同形式的網(wǎng)絡(luò)圖绊困。 ...
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（RNA-seq工具比較）edgeR文搂、limma、DESeq2三種差異表達(dá)包比較文章目錄 加載R包和輸入數(shù)據(jù) 表達(dá)數(shù)據(jù)整理3.edgeR包做差異表達(dá)4.limma包做差異表達(dá)5.DESeq2包做差異表達(dá)6.比較三種包差異表達(dá)基因篩選結(jié)果 1. 加載R包和...
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【R】clusterProfiler的GO/KEGG富集分析用法小結(jié)
前言 關(guān)于clusterProfiler這個(gè)R包就不介紹了秤朗，網(wǎng)紅教授宣傳得很成功煤蹭，功能也比較強(qiáng)大，主要是做GO和KEGG的功能富集及其可視化。簡(jiǎn)單總結(jié)下用法硝皂，以后用時(shí)可直接找...
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簡(jiǎn)短介紹下如何用GCE確定GWAS閾值
GWAS大家都很熟悉了常挚，隨著目前越來(lái)越多的重測(cè)序文章的發(fā)表，可見(jiàn)如今SNP數(shù)據(jù)是非常的豐富稽物，以及GWAS也發(fā)展了15年了奄毡，如今到了一個(gè)后GWAS時(shí)代。GWAS我也做了很多了贝或，...
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html入門（二）選擇器
選擇器 要使用css對(duì)HTML頁(yè)面中的元素實(shí)現(xiàn)一對(duì)一吼过，一對(duì)多或者多對(duì)一的控制，這就需要用到CSS選擇器咪奖。HTML頁(yè)面中的元素就是通過(guò)CSS選擇器進(jìn)行控制的盗忱。 元素選擇器作用：...
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群體分布——如何用R語(yǔ)言繪制群體地理分布Nathan寫(xiě)于2020.08.15群體的地理分布，是做文章經(jīng)常放的第一張圖羊赵，其表明你的群體材料在地理上分布的情況（感覺(jué)是一句廢話） 01 input 首先輸入數(shù)據(jù)是樣品分組...
