240 發(fā)簡(jiǎn)信
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  • 【HMMSCAN】使用pfam數(shù)據(jù)庫對(duì)多序列文件進(jìn)行結(jié)構(gòu)域注釋

    寫在前面 做基因功能的人都會(huì)特別注意基因上有什么功能結(jié)構(gòu)域眷篇,通常我們認(rèn)為,結(jié)構(gòu)域決定了這個(gè)基因的功能沾鳄。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,我們完全可以通過一級(jí)序列來預(yù)測(cè)該基因的結(jié)構(gòu)域,...

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    轉(zhuǎn)座子(TE,散在重復(fù))特征及其對(duì)基因組影響

    基因組中重復(fù)序列大體分為兩類:串聯(lián)重復(fù)(Tandem repeats,Tandem Duplication) (TRF可預(yù)測(cè))散在重復(fù)(Dispersed repeats)恕刘,...

  • 作者可以分享一下PreprocessSAMs-rmsubalig.pl嗎

    生信 | 三維基因組技術(shù)(二):Hi-C輔助組裝與Lachesis的使用

    寫在前面 以下內(nèi)容均來自我在菲沙基因(Frasergen[http://www.frasergen.com/])暑期生信培訓(xùn)班上記錄的課堂筆記 1.Hi-C 輔助組裝(PGA...

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    R數(shù)據(jù)可視化21:Edge Bundling圖

    N久沒有更新了,最近一段時(shí)間有點(diǎn)繁忙铁瞒。今天妙色,一起來學(xué)習(xí)一下一個(gè)和Circo圖差不多的圖:Edge Bunding圖(不知道中文咋翻譯)。其實(shí)在我看來都只是不同形式的網(wǎng)絡(luò)圖慧耍。 ...

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