0.僅作筆記使用 我所用到的所有腳本可以+Q 840842906索 簡單介紹一下方向也可以，說不定以后能互相幫忙～ 1. 這個工具有在線網(wǎng)頁版，當(dāng)然KEGG注釋還有其他很多工...
IP屬地：香港
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宏基因組 - (3)使用KofamKOALA對非冗余基因集進(jìn)行KEGG注釋 -
@1c43f522e1c3 biopython沒用過，知道bio系列的很多操作都封裝好了
python重命名fasta序列
fasta文件的序列名很亂怎么辦，自然是python重命名它嘍。 這里只展示兩種命名方式，一種是在“>”后面插入想要的字符串肖爵，后面的內(nèi)容不變;另一種是按照升序的方式，結(jié)合給的...
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一個表白程序的編譯與打包七夕就要到了臀脏，特意在github上搜了搜表白程序劝堪，發(fā)現(xiàn)了個CPP(C艸)寫的程序，基于Qt widget (cpp)的一個表白動畫程序揉稚。鏈接為https://hub.fast...
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阿里云盤大文件及壓縮文件分享---以7645.45 MB的SGB.Jan19為例
以PhyloPhlAn 3.0使用的7645.45 MB的SGB.Jan19數(shù)據(jù)庫上傳到阿里云盤并分享為例秒啦。 眾所周知，目前阿里云盤上傳和下載都不限速搀玖，空間也比較大余境，很適合儲...
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通路是的，map和ko一樣，不過7. Drug Development這個有map沒有ko芳来，筆記還有要改的地方
kegg pathway解析并對應(yīng)map號和ko號
昨天kegg pathway解析[http://www.reibang.com/p/beb0c3727a15]不是說后面補(bǔ)上map號和ko號的對應(yīng)關(guān)系嗎含末，今天補(bǔ)上。 昨天的...
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使用Julia給出兩點經(jīng)緯度直接計算距離給出兩點之間的經(jīng)緯度即舌，計算兩點之間的距離佣盒，使用如下公式：三角函數(shù)不必說了，Lat12是兩點的緯度差顽聂，Lon是兩點的經(jīng)度差肥惭，Lat1和Lat2分別是兩點的緯度，6378.137...
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kegg pathway解析并對應(yīng)map號和ko號
昨天kegg pathway解析[http://www.reibang.com/p/beb0c3727a15]不是說后面補(bǔ)上map號和ko號的對應(yīng)關(guān)系嗎紊搪，今天補(bǔ)上务豺。 昨天的...
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kegg pathway解析kegg pathway解析之前寫過，鏈接在此:kegg pathway三級層級結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)對應(yīng)表格[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU3MzE...
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prokka注釋tsv文件統(tǒng)計
Prokka: rapid prokaryotic genome annotation .tsvTab-separated file of all features: loc...
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awk也很棒嗦明，能給出例子嗎，awk知道一點
python重命名fasta序列
fasta文件的序列名很亂怎么辦蚪燕，自然是python重命名它嘍娶牌。 這里只展示兩種命名方式，一種是在“>”后面插入想要的字符串馆纳，后面的內(nèi)容不變;另一種是按照升序的方式诗良，結(jié)合給的...
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Rserver源碼安裝我又從源碼安裝Rstudio-server了，前面安裝的幾次都是在手機(jī)上安裝的钥弯，均以失敗告終径荔，這次不一樣，在電腦上安裝的脆霎，成功了总处，特此記錄成就。 為啥要從源碼安裝呢睛蛛？原因有三...
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python重命名fasta序列
fasta文件的序列名很亂怎么辦鹦马，自然是python重命名它嘍。 這里只展示兩種命名方式忆肾，一種是在“>”后面插入想要的字符串荸频，后面的內(nèi)容不變;另一種是按照升序的方式，結(jié)合給的...
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KO豐度轉(zhuǎn)換為pathway豐度經(jīng)常會遇到已經(jīng)有KO-number(代表基因家族信息)在各樣品中的豐度遇绞，如何轉(zhuǎn)換為level3等級的KEGG pathway(通路)豐度表呢键袱？ 目標(biāo)如下： 轉(zhuǎn)換為 首先你要通...
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ggplot2時間序列圖
廢話不多說蹄咖，先看圖 然后是代碼部分 沒有注釋，看不懂的就去學(xué)習(xí)吧付鹿。如果沒有simkai.ttf這個字體會報錯澜汤。需要選擇你電腦上有的中文字體。 對了舵匾，數(shù)據(jù)是這樣的
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WSL Ubuntu 18.04安裝R 4.0及tidyverse并解決xml2的安裝問題
首先說說為什么要寫這篇文章俊抵，原因有二：其一，WSL Ubuntu 18.04默認(rèn)的R為3.4版本有點舊坐梯，想用最新版4.0+的徽诲；其二，之前切換過ubuntu 18.04的R版本...
