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發(fā)簡(jiǎn)信
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和弦圖 - Chord Diagram -
R 數(shù)據(jù)可視化 —— grid 系統(tǒng)（二）前言 在前面一節(jié)中，我們主要介紹了如何使用 grid 來(lái)生成圖形輸出遇汞，以及圖形窗口的布局未妹。利用這些知識(shí)，可以很容易地為圖形添加注釋?zhuān)帉?xiě)一些簡(jiǎn)單的繪圖函數(shù) 這一節(jié)空入，我們將重點(diǎn)...
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兩組學(xué)關(guān)聯(lián)分析 - 相關(guān)性分析 02九象限圖 1. 九象限圖的作用 在多組學(xué)分析中络它，九象限圖具有以下重要作用： 綜合展示多組學(xué)數(shù)據(jù)關(guān)系多組學(xué)分析涉及多個(gè)層面的數(shù)據(jù)，如基因組學(xué)歪赢、轉(zhuǎn)錄組學(xué)化戳、蛋白質(zhì)組學(xué)等。九象限圖可...
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02. 將你的shinyApp分享出去shiny app 部署到遠(yuǎn)端 shinyapp.io shiny-server runURL 今天先介紹 通過(guò) runURL的方式 shinyApp 的訪問(wèn) ref:htt...
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01. shiny App 初識(shí)官方文檔https://shiny.posit.co/r/getstarted/shiny-basics/lesson1/index.html[https://shiny.p...
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兩組學(xué)關(guān)聯(lián)分析 - 相關(guān)性分析有時(shí)候轨淌，我們經(jīng)常需要探討迂烁，兩組學(xué)數(shù)據(jù)如 基因與代謝物（轉(zhuǎn)錄組與代謝組），代謝物與微生物（代謝組與宏基因組）递鹉，基因與蛋白質(zhì)（轉(zhuǎn)錄組與蛋白組）等的表達(dá)關(guān)聯(lián)盟步，就需要用到兩個(gè)組學(xué)的（...
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盤(pán)點(diǎn)強(qiáng)大的shinyUI美化包從前只知道shiny和shinydashboard，開(kāi)發(fā)簡(jiǎn)單的網(wǎng)頁(yè)是夠的躏结，但一旦對(duì)顏值有了要求却盘，就不能對(duì)html和css絲毫不知。關(guān)于shiny與CSS：https://sh...
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多組學(xué)關(guān)聯(lián)分析 -HALLA包 - linux 安裝
update at 2024.6.4 最近在搭建多組學(xué)的生信流程云平臺(tái)，需要用到一些分析的軟件包黄橘，有一些比較難安裝兆览， 比如 HALLA 安裝要求 python >= 3.7 ...
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周運(yùn)來(lái)抬探，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥帆赢，穩(wěn)健小压，瀟灑，大方椰于，靠譜怠益。一段生信緣，一棵技能樹(shù)瘾婿。生信技能樹(shù)核心成員蜻牢，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書(shū)創(chuàng)作者偏陪，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家抢呆。
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更多 bash shell 命令
來(lái)自Linux命令行與shell腳本編程大全，如有侵權(quán)竹挡，請(qǐng)聯(lián)系刪除 檢測(cè)程序ps 探查 某個(gè)時(shí)間點(diǎn)的進(jìn)程 ps -ef 查看系統(tǒng)中運(yùn)行的所有進(jìn)程 top 實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)進(jìn)程 top...
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bash shell 基礎(chǔ)命令
來(lái)自Linux命令行與shell腳本編程大全镀娶，如有侵權(quán)立膛，請(qǐng)聯(lián)系刪除 啟動(dòng)shell/etc/passwd 文件包含了所有系統(tǒng)賬戶以及每個(gè)用戶的基本配置信息 這里 root用戶...
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Luigi簡(jiǎn)單使用最近一段時(shí)間一直在跟一個(gè)Python的后端項(xiàng)目揪罕，學(xué)習(xí)了基于Python棧的一些框架和包，其中使用到了Luigi宝泵，簡(jiǎn)單做個(gè)總結(jié)好啰。 1. Luigi簡(jiǎn)介 官網(wǎng)的介紹： Luigi...
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R包安裝的一些經(jīng)驗(yàn)總結(jié)在安裝R包的過(guò)程中，經(jīng)常會(huì)遇到conda安裝不上的情況 場(chǎng)景：R虛擬環(huán)境的遷移有的時(shí)候老的R包版本過(guò)低等問(wèn)題儿奶，導(dǎo)致環(huán)境直接遷移會(huì)出現(xiàn)問(wèn)題 然后框往，再對(duì)漏掉的R包進(jìn)行單獨(dú)安裝有以...
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生信分析：常用文件數(shù)據(jù)庫(kù)地址（GO,uniref）
GO注釋下載數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)源： GO官網(wǎng)[http://current.geneontology.org/products/pages/downloads.html] 格式是GA...
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生信分析中 功能注釋常用數(shù)據(jù)庫(kù)下載地址 --- 持續(xù)更新
更新于： 2023-01-18 多線程下載工具axel的安裝和使用 Uniref90 : Diamond 數(shù)據(jù)庫(kù)格式的文件http://cmprod1.cibio.unitn...
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@songlov3 這個(gè)本來(lái)就非常耗時(shí)的 資源不夠 時(shí)間不夠是不會(huì)有結(jié)果的??
kofamscan Conda 安裝
step 1 : conda安裝 kofamscan 及其依賴 conda 會(huì)自動(dòng)安裝軟件需要的依賴 hmmer ruby parallel 等軟件，以及kofans...
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@Winter_e8d4 誰(shuí)知道哪句話說(shuō)錯(cuò)了呢
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2022.2.18 收到機(jī)考郵件闯捎，2.19進(jìn)行機(jī)考（周六）椰弊，2.21通知機(jī)考通過(guò) 2022.2.21 收到需要提供證件的郵件包括 畢業(yè)證、學(xué)位證瓤鼻；本科畢業(yè)證秉版、學(xué)位證，英語(yǔ)四六...
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應(yīng)該是最好的eggnog-mapper功能注釋教程eggnog-mapper實(shí)現(xiàn)功能注釋 eggNOG-Mapper介紹 通常功能注釋的思路都是基于序列相似性找直系同源基因清焕，常見(jiàn)的方法就是BLAST+BLAST2GO， 或者...
個(gè)人介紹
本人目前從事生信分析相關(guān)領(lǐng)域， 記錄一些常見(jiàn)的坑秸妥，也希望能幫助到類(lèi)似經(jīng)歷的人滚停。