之前寫(xiě)過(guò)一篇細(xì)胞類(lèi)型注釋的推文：?jiǎn)渭?xì)胞分析實(shí)錄(7): 差異表達(dá)分析/細(xì)胞類(lèi)型注釋[http://www.reibang.com/p/1887dbd8d9e4]亭罪，里面介紹了...
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單細(xì)胞分析實(shí)錄(14): 細(xì)胞類(lèi)型注釋的另一種思路 — CellID
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2020-10-24 RNAseq 從fq開(kāi)始分析全流程分析流程 1.上傳四個(gè)樣本原始就文件到服務(wù)器 參考http://www.reibang.com/p/a84cd44bac67[http://www.reibang.com...
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單細(xì)胞108篇文獻(xiàn)解讀之11---SCENIC: 單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù)推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和細(xì)胞功能聚類(lèi)目前單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域用的比較多的細(xì)胞聚類(lèi)方法大多是直接從基因表達(dá)矩陣推斷歧沪，但是對(duì)于多樣本合并分析，很多情況下會(huì)出現(xiàn)難以解決的批次效應(yīng)折砸，例如：有些癌癥多樣本的聚類(lèi)結(jié)果大多每個(gè)樣...
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bulk-seq數(shù)據(jù)和單細(xì)胞數(shù)據(jù)的聯(lián)合分析隨著現(xiàn)在研究的不斷深入看疗，越來(lái)越多的情況需要我們對(duì)多種數(shù)據(jù)的聯(lián)合分析，其中在單細(xì)胞沒(méi)有出來(lái)之前睦授，普通轉(zhuǎn)錄組（bulk-seq）的測(cè)序結(jié)果是非常多的两芳，也解決了我們很多的生物學(xué)問(wèn)題...
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)擬時(shí)分析之VIA（我的優(yōu)勢(shì)你們比不了）hello ，童鞋們去枷，今天我們來(lái)分享一個(gè)有關(guān)擬時(shí)分析的軟件-----VIA怖辆，文章在VIA: Generalized and scalable trajectory infer...
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cellchat-與其他單細(xì)胞分析工具的接口
與其他單細(xì)胞分析工具包的接口 從Seurat或SingleCellExperiment對(duì)象創(chuàng)建CellChat對(duì)象[http://www.reibang.com/p/cd0...
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cellchat整合多個(gè)數(shù)據(jù)集進(jìn)行細(xì)胞通訊分析Load the required libraries Create a directory to save figures Load CellChat object of ...
