這里會(huì)報(bào)錯(cuò)：Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)和(ERR): hisat2-align exited with...
發(fā)簡信
IP屬地：云南
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hisat2報(bào)錯(cuò)Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)
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單細(xì)胞細(xì)胞比例分析方法列舉1.利用箱線圖比較兩類樣本的某個(gè)細(xì)胞比例差異 比較直觀，但是缺點(diǎn)在于如果單細(xì)胞樣本個(gè)數(shù)過少且異質(zhì)性大，導(dǎo)致很難有統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著意義 2.R o/e 比值 好多文章都有用這個(gè)，我的...
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TEtranscripts：轉(zhuǎn)座子元件差異表達(dá)轉(zhuǎn)座子 ??轉(zhuǎn)座子(transposable element)：或稱跳躍基因，是一種可以改變其在基因組中位置的DNA序列恋谭，有時(shí)會(huì)產(chǎn)生或逆轉(zhuǎn)突變，改變細(xì)胞的遺傳特性和基因組大小...
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Seurat單細(xì)胞基因顯著性檢驗(yàn)函數(shù)及批量添加顯著性這篇帖子的前身可以追溯到：玩轉(zhuǎn)單細(xì)胞(2):Seurat批量做圖修飾[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTYzMzY5Ng==&mid...
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scale函數(shù)對(duì)矩陣歸一化是按行歸一化，還是按列歸一化增蹭？提出這個(gè)問題是在R package：circlize環(huán)狀熱圖[http://www.reibang.com/p/300e00fe61b6]需要對(duì)某個(gè)矩陣進(jìn)行歸一化處理，雖然...
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interproscan linux版本安裝及使用
說明：InterPro[http://www.ebi.ac.uk/interpro/]是一個(gè)整合了各種蛋白及其功能的數(shù)據(jù)庫磅摹，內(nèi)含有蛋白質(zhì)所屬的家族及其所包含的結(jié)構(gòu)域和位點(diǎn)滋迈。而...
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【單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組】人類B細(xì)胞亞群分析Marker基因匯總由于基因表達(dá)跟細(xì)胞表面蛋白的表達(dá)具有時(shí)間差，所以要根據(jù)經(jīng)驗(yàn)具體情況具體分析户誓，內(nèi)容僅供參考 ??哺乳類動(dòng)物B細(xì)胞的分化過程主要可分為前B細(xì)胞饼灿、不成熟B細(xì)胞、 成熟B細(xì)胞帝美、活化B...
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理解并操作BAM文件經(jīng)過了第四節(jié)的長文碍彭，我想大家基本上已經(jīng)知道了一個(gè)WGS流程該如何構(gòu)建起來了吧。但在那一節(jié)中限于篇幅有兩個(gè)很重要的文件我沒能展開來講悼潭，分別是：BAM和VCF文件庇忌。這篇我們先說B...
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limma差異分析Q：該如何選擇limma, DESeq2, edgeR A：各有各自應(yīng)用的場景 如果是芯片數(shù)據(jù)，一般選擇limma舰褪，畢竟它是處理芯片數(shù)據(jù)之王漆枚。 不過edgeR也可以。芯片數(shù)據(jù)...
