01 題目 :Potential drug targets for multiple sclerosisidentified through Mendelian random...
發(fā)簡信
IP屬地：香港
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發(fā)文新方向：11+高分藥靶孟德爾隨機化聯(lián)合共定位 -
高分SCI必須掌握國自然這一熱點：孟德爾隨機化+腸道菌群隨著對腸道菌群在人類健康中的重要性認(rèn)識的逐漸加深重付，越來越多的研究者開始關(guān)注腸道菌群孟德爾隨機化（Gut Microbiota Mendelian Randomization诽里，...
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ChIP-seq下游分析之motif 分析什么是ChIP-seq棚亩？ ChIP-Seq即染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)（Chromatin Immunoprecipitation胧瓜，ChIP）與二代測序技術(shù)的結(jié)合，通過染色質(zhì)免疫共...
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單細(xì)胞文章復(fù)現(xiàn)丨單細(xì)胞測序揭示肺腺癌中不同的腫瘤微環(huán)境模式文章標(biāo)題 Single-cell RNA sequencing reveals distinct tumor microenvironmental patterns in l...
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干貨分享|使用ssGSEA分析腫瘤浸潤免疫細(xì)胞上次的干貨分享我們給大家介紹的是如何利用TIDE預(yù)測腫瘤免疫逃逸（推文鏈接）身害，本期推文更加重磅狞贱，我們將給大家詳細(xì)講解生信文章免疫分析必做的——腫瘤浸潤免疫細(xì)胞。 在學(xué)習(xí)腫瘤浸...
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1區(qū)SCI新寵丨生信分析+孟德爾隨機化強強聯(lián)合上大分＠善汀Ｖ混簟！生物信息學(xué)聯(lián)和孟德爾隨機化（Mendelian Randomization扰肌，MR）是一種最新流行的研究方法抛寝，結(jié)合了生物信息學(xué)和遺傳學(xué)的優(yōu)勢，旨在深入探究單個遺傳風(fēng)險評分（Ge...
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干貨分享|利用TIDE也能預(yù)測腫瘤免疫逃逸說到免疫檢查點阻斷療法大家應(yīng)該都不陌生曙旭，其中盗舰，最富盛名的免疫檢查點就是PD-1/PD-L1了。表達在T細(xì)胞表面的程序性死亡受體（PD-1）桂躏，與表達在腫瘤細(xì)胞表面的程序性死亡配...
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NHANES數(shù)據(jù)庫怎么學(xué)钻趋？NHANES數(shù)據(jù)庫怎么學(xué)？[https://mp.weixin.qq.com/s/XLCUFNQJEXd-UCrrAiZMbw] 國家健康和營養(yǎng)檢查調(diào)查(NHANES沼头，Nat...
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重癥醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的發(fā)文利器“MIMIC”還有誰不知道Ｒ妗！进倍！重癥醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的發(fā)文利器“MIMIC”還有誰不知道Ｍ林痢！猾昆！[https://mp.weixin.qq.com/s/BugUfK5cfihGhz_QERxPCw] 對于臨床醫(yī)生來說...
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多組學(xué)水平的孟德爾隨機化分析+three-step SMR 應(yīng)用實操
多組學(xué)分析：在基因表達陶因、表觀遺傳、蛋白垂蜗、單細(xì)胞及微生物組學(xué)等水平上楷扬，利用組學(xué)數(shù)據(jù)比較不同組學(xué)水平的疾病和健康對照解幽，從而鑒定潛在的致病機制。 藥物靶點孟德爾隨機化分析：探究是其...
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什么烘苹！繪制啥阒辏基圖也有傻瓜式的操作啦？教你提升Figure的豐富度镣衡！在生信文章中霜定，我們經(jīng)常會見到看起來很賽博朋克的桑基圖——豐富色彩的虛實結(jié)合廊鸥，高級感滿滿望浩。如圖1，一些ceRNA網(wǎng)絡(luò)相關(guān)的文獻就會用啥杷担基圖來直觀的展示lncRNA磨德、miRNA、...
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詳細(xì)解讀吆视！利用ieu數(shù)據(jù)庫進行GWAS-GWAS共定位分析通過孟德爾隨機化分析典挑，確認(rèn)了兩個疾病或性狀的因果關(guān)聯(lián)并且找到顯著信號位點后，需要解釋顯著信號位點是如何影響這兩個表型的揩环。常見的一個解釋方法是共定位分析搔弄。 共定位分析通常用于鑒...
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表觀遺傳學(xué)結(jié)合轉(zhuǎn)錄組的多組學(xué)研究在癌癥診斷和治療中的應(yīng)用表觀遺傳學(xué)包括在不改變 DNA 序列的情況下染色質(zhì)的可遺傳結(jié)構(gòu)和生化改變 。表觀遺傳機制通過改變局部和全局染色質(zhì)的表觀遺傳密碼的可及性來調(diào)節(jié)相關(guān)基因表達丰滑，從而操縱各種生理和病...
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兩大經(jīng)典數(shù)據(jù)來源顾犹，帶你輕松搞定蛋白質(zhì)組學(xué)！
前面的推文（多組學(xué)聯(lián)合應(yīng)用···[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2ODk3NDkxOA==&mid=2247484306&idx=1&...
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保姆級教程褒墨！5分鐘學(xué)會繪制timeROC炫刷、multiROC（附示例數(shù)據(jù)）！文獻中常見的ROC曲線有兩種郁妈，一種是多時間點ROC（timeROC）浑玛，是不同時間點下的ROC，最常見的為1噩咪、3顾彰、5年，如圖1胃碾；一種是多指標(biāo)ROC（multiROC）涨享，是不同變...
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PheWAS+GWAS直沖一區(qū)9+SCIPheWAS，全表型組關(guān)聯(lián)分析(又稱反向GWAS)仆百，是考察全表型組范圍所有表型與某一SNP之間的關(guān)聯(lián)的方法厕隧。其主要是為了彌補GWAS在全基因組范圍發(fā)掘基因多效性方面的不足(G...
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手把手教你從GSEA下載目標(biāo)基因集并使用maftools包繪制瀑布圖！很多情況下，我們進行生信分析都會有一個感興趣的點吁讨，可以是免疫髓迎、m6A甲基化、鐵死亡建丧、銅死亡等等排龄，但有很多小伙伴不知道到哪里去尋找并下載目標(biāo)基因集。本期推文茶鹃，小碗不僅會給大家介...
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兩樣本孟德爾隨機化代碼實操
前面給大家介紹了孟德爾隨機化的概念和它所包含的內(nèi)容以及一些注意事項涣雕，忘記的同學(xué)可以復(fù)習(xí)一下哦（一文帶你讀懂孟德爾隨機化 - 簡書 (jianshu.com)[https://...
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基因組學(xué)艰亮、轉(zhuǎn)錄組學(xué)闭翩、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)——多組學(xué)聯(lián)合應(yīng)用迄埃，你知道多少疗韵？各位小伙伴大家好，今天給大家分享的是我們經(jīng)常聽到的一個名詞——組學(xué)侄非，包括我們所知道的基因組學(xué)蕉汪、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)以及代謝組學(xué)等逞怨≌甙蹋“組學(xué)”這個詞字如其面，也就是說我們研究的是一...
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學(xué)森林圖叠赦？看這篇就夠了驹马！在之前的推文（單因素、多因素COX回歸分析在R中的實現(xiàn)與常見問題解答 - 簡書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/0fa217a...