一車(chē)小面包人

背景：?jiǎn)渭?xì)胞VDJ的背景、原理等。 1.為什么做單細(xì)胞VDJ州胳？ 理論上生物體內(nèi)的基因組DNA是完全相同的纱注，除了腫瘤細(xì)胞會(huì)發(fā)生頻繁的DNA突變窃页。因此呜叫，常規(guī)的單細(xì)胞研究不用關(guān)心D...

xizzy

隨著單細(xì)胞技術(shù)的發(fā)展和普及帐要，越來(lái)越多的課題組開(kāi)始使用單細(xì)胞技術(shù)進(jìn)行自己的課題研究侦香。然而落塑，在單細(xì)胞的注釋上，商業(yè)公司提供的流程化注釋往往難以滿足實(shí)際的需求罐韩，甚至得到牛頭不對(duì)馬嘴...

ZZZZZZ_XX

測(cè)序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw r...

不到7不改名

edgeR and DESeq2, part2-獨(dú)立過(guò)濾 ? 過(guò)濾低read計(jì)數(shù)的基因散吵，又名獨(dú)立過(guò)濾(Independent Filtering)龙考。 ? ...

單細(xì)胞空間交響樂(lè)

作者，Evil Genius~~ 空間轉(zhuǎn)錄組的運(yùn)用方向：轉(zhuǎn)錄矾睦、蛋白 ST最適合回答三種生物問(wèn)題：首先可以闡明組織的細(xì)胞類(lèi)型組成晦款；第二類(lèi)問(wèn)題與細(xì)胞相互作用有關(guān)；最后可以幫助闡明...

Bio_Infor

小小的眼睛里枚冗，裝著……大大的疑惑 全文2800字缓溅，傷腦筋…… 今天嘗試把自己對(duì)于 stranded、reverse-stranded赁温、un-stranded 這個(gè)問(wèn)題的理解給...

xizzy

相信學(xué)習(xí)生信的小伙伴不難發(fā)現(xiàn)，在定量的時(shí)候大多的文章或者公司的結(jié)果都有這幾種定量的方式：FPKM（RPKM）股囊，TPM袜匿，CPM(RPM)還有count等等，這些究竟該如何使用稚疹，...

xizzy

REACTOME 是一個(gè)開(kāi)源、放開(kāi)、人工整理并經(jīng)過(guò)同行評(píng)審的通路數(shù)據(jù)庫(kù)穆壕。目標(biāo)是為各個(gè)通路提供可視化待牵、可解釋的分析，以支持基礎(chǔ)研究喇勋、臨床研究、基因組分析偎行、建模川背、系統(tǒng)生物學(xué)等。 ...