IP屬地：江蘇
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“Simplicity is the ultimate sophistication.”
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個人學習生信的一點心得 歡迎討論指摘
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農(nóng)學跨生信蹬碧，之前總覺得舱禽，沒人教，怕走彎路恩沽，遲遲不肯踏踏實實從基礎一點一點積累慢慢學起誊稚。一會看看生物，一會寫寫代碼罗心，抓不住重點也沒有提高里伯。 后來關注了生信技能樹，還蹭了建設人Jimmy大佬組織的線下聚會渤闷，聽到幾位大佬介紹后疾瓮，發(fā)現(xiàn)他們都是自學，自己摸索的飒箭，并且給我強調(diào)了記筆記的重要性狼电。 這是一個對知識管理的過程，記錄下學習的一點一滴弦蹂，寫下來的筆記是給自己的（有時候會覺得寫的不好肩碟，也不敢分享出來，沒有正向激勵凸椿，漸漸就不寫了）削祈，當然如果也可以像大佬們那樣對他人的學習起到幫助，我也會覺得非常榮幸和開心吶脑漫。 加油啦～～
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一些生物信息學用到的軟件，工具网杆，介紹用法安裝以及以及應用的文章 ?? 測序組裝使用的Spades密末、canu等等 ?? 序列比對比如blast、bowtie跛璧、diamond等 ?? 多序列比對比如mega严里、clustalW、matff等 ?? 序列格式轉(zhuǎn)化的samtools追城、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS刹碾、MISO ?? 微衛(wèi)星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進化樹構建工具IQtree、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL座柱、OrthoFinder等 ?? 尋找測序中的結構變異或者SNP序列GATK迷帜、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o物舒、QIMME ?? 測序質(zhì)量評估的FastQC、BUSCO戏锹、QUAST ?? 可視化工具比如IGV冠胯、3D Genome ?? 測序數(shù)據(jù)下載工具SRA Toolkit、ascp等 ?? 數(shù)據(jù)可視化的工具circos 等等
