標(biāo)題：Glioma CpG island methylator phenotype (G-CIMP): biological and clinical implicatio...
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IP屬地：廣東
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膠質(zhì)瘤綜述1：膠質(zhì)瘤CpG島甲基化表型(G-CIMP):生物學(xué)和臨床意義 -
DENDRO:利用scRNA seq進(jìn)行基因異質(zhì)性分析和亞克隆檢測盡管現(xiàn)在scRNA-seq廣泛應(yīng)用于腫瘤內(nèi)異質(zhì)性的研究中蛉顽，體細(xì)胞突變的檢測和從scRNA-seq推斷克隆成信息可能并不準(zhǔn)確讳窟。這里棒卷，我們提出了DENDRO萧求，這是一種分析scRN...
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10xGenomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組TSNE圖+等高線需求 ??最近在看一篇2018年science腎臟細(xì)胞癌文獻(xiàn)的時候姻乓，發(fā)現(xiàn)一張比較好看的TSNE圖想幻，上面的每個聚類中有等高線恋谭，覺得作者畫的挺好看的场斑，我們平時做10xGenomi...
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測序數(shù)據(jù)的深度漓踢、覆蓋度等計算Coverage Depth 覆蓋深度 mapping depth 基因組被測序片段（短讀 short reads）“覆蓋”的強(qiáng)度有多大？ 每一堿基的覆蓋率是基因組堿基被測序...
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96-非監(jiān)督學(xué)習(xí)之SOM非線性降維SOM（Self Organizing Maps漏隐，自組織映射）本質(zhì)上是一種只有輸入層--隱藏層的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)喧半。輸入層神經(jīng)元的數(shù)量是由輸入數(shù)據(jù)的維度決定的，一個神經(jīng)元對應(yīng)一個特征青责，...
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全外顯子組測序——壹.簡介
歡迎關(guān)注公眾號oddxix 1.技術(shù)原理 在人類基因中大約有180,000個外顯子挺据，占人類全部基因組的1%，約30MB脖隶。人類基因組的蛋白編碼區(qū)大約包含85%的致病突變扁耐。外顯子...
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8 比對及找變異步驟的質(zhì)控使用qualimap對wes的比對bam人家總結(jié)測序深度和覆蓋度 1 比對的各個階段的bam進(jìn)行質(zhì)控 可以把中間生成的.bam文件刪除，就是帶marked的bam文件 安裝b...
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JupyterNotebook小技巧合集智能決策上手系列教程索引 不斷更新部分內(nèi)容來自于翻譯整理 Jupyter Notebook可能是當(dāng)今最常用的數(shù)據(jù)科學(xué)工具 寫Python代碼很多人會告訴你要用Pycharm产阱，...
