二項(xiàng)分布和泊松分布都描述的是事件成功次數(shù)的分布包颁,泊松分布是二項(xiàng)分布的極限分布雀鹃,其適用條件是n很大俩块,p很小的情況该互。生物學(xué)中一些過程可以使用二項(xiàng)分布或者泊松分布來模擬。 1. 使...
二項(xiàng)分布和泊松分布都描述的是事件成功次數(shù)的分布包颁,泊松分布是二項(xiàng)分布的極限分布雀鹃,其適用條件是n很大俩块,p很小的情況该互。生物學(xué)中一些過程可以使用二項(xiàng)分布或者泊松分布來模擬。 1. 使...
數(shù)據(jù)分析時(shí)我們經(jīng)常會(huì)遇到多組treatment和control,多個(gè)細(xì)胞系,多種組學(xué)數(shù)據(jù)類型的情況颂斜,用ggplot或者matplotlib作圖時(shí)就要頭疼選顏色的問題,這里有一...
R語言中繪制熱圖heatmap的包(package)有很多拾枣,除了許多炫酷的第三方包外沃疮,系統(tǒng)自帶的image函數(shù)使用起來也十分方便靈活。 1.主要繪制參數(shù) 2.繪制常規(guī)heat...
RegulomeDB和HaploReg數(shù)據(jù)庫提供了將大量基因組學(xué)數(shù)據(jù)與非編碼突變整合的思路梅肤。 1.背景 GWAS研究產(chǎn)生了大量的SNP忿磅,大部分在非編碼基因組 這些SNP其實(shí)是...
本篇主要內(nèi)容 本篇主要介紹兩種方法黔寇,搜索并批量下載ENCODE數(shù)據(jù)。 方法一:在頁面中搜索并獲取下載地址 進(jìn)入ENCODE portal主頁:https://www.enco...
2333
玩轉(zhuǎn)ENCODE項(xiàng)目的數(shù)據(jù)資源(一)本系列主要內(nèi)容 介紹ENCODE的數(shù)據(jù)概況斩萌,在data portal上查詢數(shù)據(jù)缝裤,使用REST API批量下載數(shù)據(jù),參照ENCODE官方數(shù)據(jù)處理流程構(gòu)建自己的pipeline颊郎。...
本系列主要內(nèi)容 介紹ENCODE的數(shù)據(jù)概況憋飞,在data portal上查詢數(shù)據(jù),使用REST API批量下載數(shù)據(jù)姆吭,參照ENCODE官方數(shù)據(jù)處理流程構(gòu)建自己的pipeline榛做。...
哈哈 謝謝!一起進(jìn)步
基因組學(xué)數(shù)據(jù)分析常用的在線資源奮斗在人類組學(xué)數(shù)據(jù)分析的一線内狸,要隨時(shí)跟上最新的研究進(jìn)展检眯。大型的研究項(xiàng)目會(huì)有全面的數(shù)據(jù)集和可視化工具,也有專門從各個(gè)數(shù)據(jù)源收集數(shù)據(jù)整合而成的數(shù)據(jù)庫昆淡。手頭備幾個(gè)锰瘸,方便查閱。 Ge...
奮斗在人類組學(xué)數(shù)據(jù)分析的一線瘪撇,要隨時(shí)跟上最新的研究進(jìn)展获茬。大型的研究項(xiàng)目會(huì)有全面的數(shù)據(jù)集和可視化工具港庄,也有專門從各個(gè)數(shù)據(jù)源收集數(shù)據(jù)整合而成的數(shù)據(jù)庫。手頭備幾個(gè)恕曲,方便查閱鹏氧。 Ge...
作為一名生物信息“工程師”,日常的工作環(huán)境是基于Unix的計(jì)算機(jī)集群听盖,因此最常用的就是shell腳本胀溺。它可以簡單的處理數(shù)據(jù),再加上迷你語言sed和awk皆看,也能滿足日常需求了仓坞。...