這里是佳奧懂缕，我們繼續(xù)RNA-Seq分析的結(jié)果探究报亩。 第三步，DEG-差異分析。 1 RNA-Seq結(jié)果分析：DEG 歸一化后表達(dá)量成一條線了。 2 ChIP-Seq結(jié)果分析：...
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【表觀調(diào)控 實戰(zhàn)】五罩锐、DEG分析與peaks注釋分析 -
【ChIP-seq 實戰(zhàn)】五、合并bam和去除PCR重復(fù)
這里是佳奧月腋！ 獲得了比對的bam文件，生成了index的bai文件瓣赂，生成了比對結(jié)果stat文件榆骚。 合并bam文件和去除PCR重復(fù)沒有嚴(yán)格先后順序，是否必要根據(jù)文章決定 1 合...
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minimap2參數(shù)詳解
minimap2是我們在基因組分析過程常用的一種工具职恳，但是它的參數(shù)很多很復(fù)雜，現(xiàn)在我將各項參數(shù)的內(nèi)容和用法進(jìn)行解析方面。 實例(polish 第一步)
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三代測序數(shù)據(jù)簡單分析
三代測序數(shù)據(jù)簡單分析 原創(chuàng) saber universebiologygirl 簡單介紹： 三代測序技術(shù)讀長較長放钦，針對比較小的基因組像只有16kbp的人類線粒體DNA（mtD...
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入門流程 | 三代測序基因組從[ 組裝 ]到[ 評估 ]- Pacbio、Flye恭金、Quast寫在前面 最近操禀，帶一個師妹了解并做了簡單的基因組組裝工作，感覺其上手速度還可以横腿。慢慢地有初窺生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析門徑的樣式颓屑，于是....還是鼓勵她整理整理流程，分享分享（其實....
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wtdbg2 | 三代測序數(shù)據(jù)組裝軟件③
wtdbg2軟件介紹 wdbg2能利用三代Pacbio 或 Nanopore 測序數(shù)據(jù)進(jìn)行基因組組裝耿焊。在組裝過程中揪惦，軟件將reads打斷成長度為1024 bp的片段（類似km...
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全長轉(zhuǎn)錄組 | Iso-Seq 三代測序數(shù)據(jù)分析流程 (PacBio) （1）我也認(rèn)為長讀長測序是 RNA 測序的未來！隨著價格的降低和堿基質(zhì)量的提升罗侯，傳統(tǒng)的二代RNA-seq會被逐漸取代器腋。 很多物種的轉(zhuǎn)錄本非常多樣和復(fù)雜，絕大多數(shù)真核生物基因不符合“...
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ChromHMM使用方法
ChromHMM教程ChIPseq教程從這個網(wǎng)站下載數(shù)據(jù)，放在Bed_input文件夾里面纫塌。同時按照上述教程制作與下載的bed文件同樣名字的cellmarkfile.txt文...
