我安裝了一天之后快哭了，然后去100塊買了個(gè)老師指導(dǎo)生信自學(xué)要么哭要么花錢，就是我這個(gè)垃圾1、安裝https://github.com/ventolab/CellphoneD...
發(fā)簡(jiǎn)信
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cellphoneDB嘔心瀝血下載安裝教程
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TCR-seq數(shù)據(jù)分析(一)前言 ??一不小心2020年又過(guò)完了，回望這一年的收獲，算了，還是不回望了。作為2020年的最后一貼伞鲫，今天來(lái)跟大家談?wù)勅绾畏治鯰CR-seq的數(shù)據(jù)，全稱T-cell rece...
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scanpy踩坑實(shí)錄日常瞎掰 ??最近在分析scRNA-seq的數(shù)據(jù)签舞，三個(gè)樣本數(shù)據(jù)不大秕脓，用Seurat分析真的很香！奈何又要下載公共數(shù)據(jù)的樣本儒搭，這樣一搗騰吠架，Seuart倒顯得有些力不從心了，何也...
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Seurat包合并多個(gè)單細(xì)胞樣本示例數(shù)據(jù)：GSE139324有63個(gè)samples搂鲫。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE1393241...
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RNA-seq中的常見問(wèn)題匯總參考鏈接：http://www.huangshujia.me/2018/05/26/2018-05-26-How-Does-Sequencing-Duplicates-hap...
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R語(yǔ)言--并行計(jì)算包（parallel诵肛、foreach）
R語(yǔ)言是單核計(jì)算語(yǔ)言，在數(shù)據(jù)建哪ǎ或計(jì)算過(guò)程中怔檩，常常出現(xiàn)相同或相似任務(wù)的重復(fù)計(jì)算，一般操作是for循環(huán)處理或采用apply族函數(shù)處理蓄诽，為了更快完成計(jì)算薛训，采用并行計(jì)算是更優(yōu)的選擇...
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快速實(shí)現(xiàn)人和小鼠之間的同源基因轉(zhuǎn)換
我們知道小鼠是一個(gè)研究很多的模式生物，有很多生物學(xué)研究仑氛，以及一些臨床研究都是在小鼠上做的乙埃。那么小鼠里面研究的這個(gè)基因在人里面有沒(méi)有，對(duì)應(yīng)的具體又是一個(gè)什么基因锯岖，這是我們經(jīng)常需...
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450k甲基化基礎(chǔ)（一）基本概念 1. 什么是DNA甲基化 DNA甲基化是表觀遺傳學(xué)的中最為常見的一種修飾介袜，其主要形式包括：5-甲基胞嘧啶 (5-mC)、少量的N6-甲基腺嘌呤 (N6-mA) 以及...
