發(fā)簡(jiǎn)信
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cj的院服務(wù)器數(shù)據(jù)下載及平臺(tái)搭建激活環(huán)境 conda activate cj 如何看有啥軟件已經(jīng)安裝 conda list aspera下載數(shù)據(jù) 記得聯(lián)網(wǎng)（悄悄地） 查找asc...
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R獲取KEGG/GO中某一通路所有基因1银亲、通過(guò)KEGGREST包來(lái)探索KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)的12大代謝通路 通過(guò)觀察KEGG官網(wǎng) ：https://www.genome.jp/kegg/p...
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根據(jù)轉(zhuǎn)錄組和KEGG代謝基因計(jì)算通路活性０省！颊艳！計(jì)算方法是以前初師兄根本文獻(xiàn)扒的囚企，后續(xù)把文章doi附上？兜酢Ｂ鹧取燎猛！KEGG基因list,利用R可以很快扒下來(lái)，我后面再更新照皆，百度一下你就知道 準(zhǔn)...
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count轉(zhuǎn)fpkm和tpm以下列數(shù)據(jù)為例子重绷，需要count矩陣并包含基因長(zhǎng)度、（沒(méi)有的話(huà)從gtf提取膜毁，前面我寫(xiě)過(guò)教程） count矩陣讀入 count to TPM co...
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轉(zhuǎn)錄組服務(wù)器配置以大設(shè)施anlei01環(huán)境為例 1昭卓、配置miniconda軟件 2、設(shè)置環(huán)境 建立一個(gè)RNA-seq分析環(huán)境瘟滨，這樣是為了和其他環(huán)境區(qū)分開(kāi)候醒，以免本...
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越哥服務(wù)器上分析流程留存
把sortbam文件全部上傳到越哥服務(wù)器上給服務(wù)器上安裝了bedgraphtobw,直接用就行了傳文件使用的命令是 1、合并bam 2杂瘸、bam轉(zhuǎn)...
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conda裝好軟件后庫(kù)文件缺失問(wèn)題在學(xué)校服務(wù)器上conda安裝軟件后 提示安裝成功但是bowtie2報(bào)錯(cuò)缺失庫(kù)文件 由于我是非root用戶(hù)倒淫，權(quán)限受限在兩位老師@exps和@wan...
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越哥cuttag分析代碼留存
1、trim_galore去接頭及低質(zhì)量reads 使用nohup掛后臺(tái)后可以用jobs -l查看 跑完以后在clean文件夾下胧沫，會(huì)有val_1...
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【傻瓜美圖】cellphonedb氣泡圖從cellphonedb得到以下四個(gè)文件昌简，用中間兩個(gè)畫(huà)圖 畫(huà)圖