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在GWAS分析之前寡具,一般需要對基因型文件進行過濾蓝谨,包括:缺失率潜秋、MAF邓线、雜合率爷怀、雙等位麦牺、僅SNP等稀并。 運用bcftools進行進行雙等位和僅SN...
fdisk最大只支持2T的硬盤蝴蜓,推薦gdisk進行分區(qū) 利用lsblk命令列列出新建的分區(qū) 再利用mkfs.ext4命令對新建的分區(qū)進行格式化 ...
輸入數據格式為: 利用該腳本碟绑,可以獲得標記的等位信息、雜合率茎匠、MAF格仲、缺失率及PIC值。
在perl處理fasta文件是诵冒,需要每次讀入一個完整的 序列頭+序列凯肋,需要利用到 將perl默認的行分隔符切換為">"。 且從文件中第一次讀取的...
利用bedtools能夠快速批量的提取基因組上指定區(qū)域的序列汽馋。 1. Example: 文件說明example_genome.fasta基因組序...
這個perl腳本的作用是將Mega等軟件比對保存的fasta格式的結果轉化為KaKs_Calculator軟件需要的AXT的輸入格式侮东∪可以通過下...
example: #!/usr/bin/perl -w use warnings; =pod XXX .... =cut