簡介 寬數(shù)據(jù)：寬數(shù)據(jù)是比較常用的數(shù)據(jù)收集與儲存樣式，第一行一般是表頭數(shù)據(jù)，表示觀測項目名字，如溫度、pH荒椭、風速等。每一列包含所觀測到的數(shù)據(jù)。 長數(shù)據(jù)：長數(shù)據(jù)是分析繪圖中可能會...
發(fā)簡信
IP屬地：北京
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R — 長數(shù)據(jù)寬數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換 -
實操|(zhì)rrBLUP包RRBLUP數(shù)據(jù)處理 VCF轉(zhuǎn)為 rrBLUP {-1,0,1} 格式 rrBLUP可識別的基因型格式為 {-1,0,1} （行頭為marker吼蚁，列為sample），因此需要對基本數(shù)據(jù)...
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去回歸育種值（Deregressed EBV）的計算
去回歸是一種去除方差異質(zhì)性的方法问欠，在某類數(shù)據(jù)處理時偶爾用到肝匆，比如估計基因組選擇育種值時。借著文獻Thistlethwaite2019[1]來學習一下DEBV是怎么計算的顺献。 該...
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育種值探秘丨動植物遺傳育種
育種值：生物的數(shù)字密碼 嗨旗国，大家好！今天分享的筆記是遺傳育種領域中那神秘莫測的育種值注整。這個抽象的名詞具體如何理解能曾？為什么說育種值很重要？具體怎么計算肿轨？有什么用處寿冕？ 別擔心，我...
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國內(nèi)外肉牛遺傳評估體系概況（2021-07-29）
今天看到一篇中文的肉牛遺傳評估的綜述椒袍，其對國內(nèi)外的肉牛遺傳估計發(fā)展進行介紹驼唱，個人認為總結(jié)比較完善，故進行記錄和轉(zhuǎn)載驹暑。 摘要：種公牛的選育是肉牛育種工作的核心玫恳。傳統(tǒng)選育肉用種公...
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GWAS分析結(jié)果的顯著性閾值選擇
繪制曼哈頓圖的時候，需要指定一個顯著的閾值線常規(guī)的閾值是0.05/n或0.01/n优俘。n是基因型的標記數(shù)量（snp的數(shù)量）京办。但是因為存在連鎖不平衡，很多時候按照上面的這個閾值帆焕，...
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【R-statistics】方差分析方差分析(ANOVA) 什么是方差分析 模型可以歸納為在解決預測問題 Q：如何評價預測結(jié)果的好壞惭婿？A：預測和模型越接近越好Q：如何刻畫”接近“？A：需要定義”距離“视搏，一般使用...
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除了ChatGPT审孽，深度學習還能為分子育種領域帶來什么？前段時間大火的ChatGPT又一次讓深度學習和人工智能展示在大眾目光之下浑娜，深度學習的應用也從專業(yè)走向生活佑力。那么對于動植物育種的研究者來說深度學習可以為品種馴化和選育帶來什么?...
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Fine mapping定位QTL作物遺傳育種需要發(fā)掘?qū)r(nóng)藝性狀有重要貢獻的QTL。某一重要農(nóng)藝性狀往往是由多個QTL調(diào)控筋遭。對這些QTL進行精細定位找出對應的基因?qū)ψ魑锏母牧季哂兄匾饬x打颤。本文對如何進行...
