ABBA-BABA分析方法最早發(fā)布于2012年NATURE的文章：Butterfly genome reveals promiscuous exchange of mimic...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖北
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ABBA-BABA遺傳滲入分析（Dsuite軟件） -
RIdeogram：染色體數(shù)據(jù)可視化的R包已有的工具如circos, 只能繪制彎的染色體涂臣，又如R包c(diǎn)hromoMap蛆挫，IdeoViz星虹，karyploteR壶唤，ggbio和在線工具Idiographica，雖然能繪制直的...
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序列比對(duì)軟件 MUMmer 高級(jí)使用（二）
快速上手的話見上一篇军援，這篇詳細(xì)介紹一下 MUMmer 4 軟件下 nucmer 程序的詳細(xì)參數(shù)。 序列比對(duì)軟件 MUMmer 快速上手（一）[https://www.jian...
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選擇清除分析軟件XP-CLR的安裝折騰之路1. 原版 安裝比較簡(jiǎn)單鸠补。 直接運(yùn)行bin下的XPCLR即可，若不能運(yùn)行嘀掸，則編譯下： 原版分析時(shí)準(zhǔn)備文件過程較為繁瑣紫岩，因此更建議使用Python版。 2. Python版本 ...
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自然雜交研究中有關(guān)漸滲和基因流的軟件2021-08-05
(1)Migrate-n （2)BayesASS3 (3)NewHybrids (4)parallelnewhybrid (5)introgress (6)ABBA-BABA...
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使用GEMMA進(jìn)行復(fù)雜性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)GEMMA（Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm）是一款基于混合線性模型的GWAS分析軟件（文獻(xiàn)信息...
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10.GWAS：LD decay(LD衰減）—— PopLDdecay關(guān)于連鎖不平衡的詳細(xì)介紹在之前的帖子里有說過睬塌，這里就不再贅述泉蝌，本篇主要介紹LD decay的計(jì)算。1.GWAS：原理與目的 - 簡(jiǎn)書 (jianshu.com)[https:...
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TRF (Tandem Repeat Finder) 搜尋串聯(lián)重復(fù)序列官網(wǎng)：http://tandem.bu.edu/trf/trf.html[http://tandem.bu.edu/trf/trf.html] 一衫仑、安裝 conda一鍵安裝 ...
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利用氨基酸計(jì)算mcmc分化時(shí)間1. 多序列比對(duì)文件轉(zhuǎn)phylip 樹文件梨与，在orthofinder下面由物種樹直接拷貝，刪除枝長(zhǎng)文狱。 3.修改ctl文件 4. 運(yùn)行第一次mcmc粥鞋，生成out.BV，利用co...
