背景 群體遺傳學(xué)中測(cè)出很多個(gè)個(gè)體封锉，得到了最終的SNP vcf文件瞒滴，需要將其分成群體胞谭，看哪幾個(gè)物種聚在一起楚午。一般使用的軟件就是STRUCTURE止后，但是STREUTURE運(yùn)行速度...
IP屬地：海南
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GWAS 學(xué)習(xí)之a(chǎn)dmixture
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使用CMplot包繪制環(huán)形曼哈度圖安裝并加載所需R包 基本用法 常用參數(shù) 加載并查看示例數(shù)據(jù) 基本數(shù)據(jù)格式： 前三列分別為SNP的名稱须揣，所在染色體，SNP的位置驮审，后面每列為不同性狀的P值鲫寄，每個(gè)性狀單獨(dú)一列 默...
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群體遺傳學(xué)習(xí)專題 一
群體遺傳學(xué)習(xí)專題 一之基礎(chǔ)知識(shí)整理 群體遺傳學(xué)研究對(duì)象是生物群體，這里的群體是指孟德?tīng)柺先后w疯淫。它是由同一物種組成的較大的有性繁殖群體地来。群體內(nèi)的個(gè)體間是隨機(jī)交配的，遵循孟德?tīng)栠z...
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群體結(jié)構(gòu)分析軟件Structure了解和使用一峡竣、簡(jiǎn)介 Structure 是一個(gè)利用遺傳標(biāo)記推斷群體遺傳結(jié)構(gòu)的軟件靠抑。其功能包括推斷群體數(shù)目，判斷某個(gè)個(gè)體屬于哪個(gè)群體适掰，鑒別遷移個(gè)體及雜合體等。舉個(gè)例子 上圖中顏色的種類即...
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群體遺傳學(xué)基礎(chǔ)知識(shí)
轉(zhuǎn)載自：http://www.reibang.com/p/7d4e4948b623 群體遺傳學(xué)基礎(chǔ)知識(shí) 群體（Polulation）：是指生活在一定空間范圍內(nèi)荠列，能夠相互交配...
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群體遺傳學(xué)-選擇清除分析一类浪、中性學(xué)說(shuō) 分子水平上，生物的演化或物種的進(jìn)化并不是自然選擇引起的肌似，而是由中性/近中性的突變等位基因經(jīng)過(guò)遺傳漂變引起的费就，從而形成分子水平上的進(jìn)化性變化或種內(nèi)變異。分子演化的...
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Tajima's D 中性檢測(cè)的指標(biāo)
Tajima's D - Wikipedia[https://en.wikipedia.org/wiki/Tajima%27s_D] Tajima's D是由日本研究員田田文...
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基因家族分析全套軟件
基因家族生物信息學(xué)分析 （1）基因家族分析概述 旁系同源基因 基因家族可通過(guò)基因復(fù)制進(jìn)行物種特異性擴(kuò)增川队，主要有染色體片段復(fù)制力细、串聯(lián)復(fù)制和反轉(zhuǎn)錄子轉(zhuǎn)座等三種形式睬澡，可能導(dǎo)致功能丟...
