看了這個之后缝驳，對作者肅然起敬
從零開始完整學(xué)習全基因組測序（WGS）數(shù)據(jù)分析：第4節(jié) 構(gòu)建WGS主流程這篇文章很長虹蓄，超過1萬字，是本系列中最重要的一篇姓赤，因為我并非只是在簡單地告訴大家?guī)讞l硬邦邦的操作命令。對于新手而言不建議碎片時間閱讀枉证，對于有一定經(jīng)驗的老手來說以躯，相信依然可以有...
發(fā)簡信
IP屬地：寧夏
-
-
aria2（命令行下載器）使用
aria2 是一個自由、開源湖饱、輕量級多協(xié)議和多源的命令行下載工具掖蛤。它支持 HTTP/HTTPS、FTP井厌、SFTP蚓庭、 BitTorrent 和 Metalink 協(xié)議致讥。aria...
-
【哈佛大學(xué)：計算生物學(xué) & 生物信息學(xué)】學(xué)習記錄（三）局部比對算法 —— Smith-Waterman Algorithm Swimt-Waterman算法本質(zhì)上是一種Dynamic Programming（動態(tài)規(guī)劃算法）授舟，和N...
-
RcisTarget || 從基因列表到調(diào)控網(wǎng)絡(luò)單細胞技術(shù)正在加強我們對細胞本身的理解。什么是細胞類型奢啥，不就是基因選擇性表達的結(jié)果嗎秸仙？而基因的選擇表達受到一系列的轉(zhuǎn)錄調(diào)控，在這個意義上桩盲，細胞命運背后的驅(qū)動力在于各自轉(zhuǎn)錄因子...
-
簡單了解蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)(PPI)蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)（PPI） 蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)（Protein-Protein Interaction Networks寂纪，PPI）是由蛋白通過彼此之間的相互作用構(gòu)成，來參與生物信號...
-
meshes包加載報錯
在加載meshes包的時候出現(xiàn)了下面的報錯： library(meshes) Error: package or namespace load failed for ‘mes...
-
您好赌结，非常感謝您寫了這篇文章捞蛋，在這里，我有一個疑問柬姚，就是identifyDistal3UTR運行之后生成的結(jié)果文件里面Gene symbol為什么都是NA
APAtrap的使用
網(wǎng)站：https://sourceforge.net/projects/apatrap/ 說明書：https://sourceforge.net/p/apatrap/wiki...
-
獲取基因組的bed拟杉、gtf注釋文件先來看一下常見的基因組注釋格式 bed gtf gff 需要特別注意的是，bed的每一行記錄是左閉右開區(qū)間量承，并且以0作為染色體的起始搬设；而gtf的每一行記錄是包括區(qū)間的兩端的，...
-
當樣本的重復(fù)數(shù)不相等時夜畴，用DESeq2怎么進行差異分析總的實驗設(shè)計（實驗組與對照組以及樣本的重復(fù)數(shù)） 使用DESeq2進行基因表達的差異分析 繪制PCA plot 和heatmap以及對結(jié)果提取差異分析的結(jié)果 不同的組之間的差異...
-
我用到的Samtools介紹記錄一下我用到的samtools的用法税灌。 samtools的說明文檔：http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtml[http:...
-
-
Windows下更新R版本及RstudioWindows下更新R版本及Rstudio 今天在下載APAlyzer這個包的時候一直不成功粘秆，提示了各種錯誤如迟，然后去bioconductor查看了一下APAlyzer的安裝，...
-
ggplot2筆記——初步摸索ggplot2筆記里面采用的是R里面內(nèi)置的數(shù)據(jù)集進行畫圖的攻走，數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)比較簡單你氓涣，便于理解。筆記參考的圖書是《數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn) 》by 【美】托馬茲·卓巴斯（Tomasz Dra...
-
-
個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
-
公眾號：青檸學(xué)術(shù)别凹。分享優(yōu)質(zhì)的科研技巧草讶、效率工具。
